25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0105 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0105  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  568  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0118  hypothetical protein  26.75 
 
 
262 aa  99.8  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0127  hypothetical protein  26.55 
 
 
258 aa  94.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2809  hypothetical protein  26.92 
 
 
259 aa  90.5  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.311131  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4216  hypothetical protein  24.12 
 
 
264 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.338964  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0302  hypothetical protein  25.79 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202407  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0251  hypothetical protein  25.65 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00748902  normal  0.467575 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3449  hypothetical protein  27.5 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.419129 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1147  hypothetical protein  25.42 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1655  protein of unknown function DUF1217  26.92 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.939234 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3881  flagellar basal-body rod protein FLGF  24.46 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0287836  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4159  hypothetical protein  25.4 
 
 
262 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0365541  normal  0.446399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6503  hypothetical protein  32.41 
 
 
414 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2474  hypothetical protein  24.88 
 
 
801 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.958646 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0592  protein of unknown function DUF1217  23.9 
 
 
1111 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.535986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0691  protein of unknown function DUF1217  30.16 
 
 
417 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0545  protein of unknown function DUF1217  21.78 
 
 
1111 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000988824  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1710  hypothetical protein  33.64 
 
 
472 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214563  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0680  hypothetical protein  29.37 
 
 
417 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6502  hypothetical protein  28.85 
 
 
429 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0969  hypothetical protein  21.5 
 
 
727 aa  49.3  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.685924  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0654  protein of unknown function DUF1217  28.57 
 
 
417 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5254  protein of unknown function DUF1217  20.35 
 
 
727 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5534  protein of unknown function DUF1217  19.9 
 
 
738 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0479  hypothetical protein  21.62 
 
 
822 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>