29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2809 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2809  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  521  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.311131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1655  protein of unknown function DUF1217  52.33 
 
 		 259 aa  268  7e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.939234 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0118  hypothetical protein  47.51 
 
 		 262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4216  hypothetical protein  46.74 
 
 		 264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.338964  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0127  hypothetical protein  47.64 
 
 		 258 aa  238  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0251  hypothetical protein  41.54 
 
 		 259 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00748902  normal  0.467575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0302  hypothetical protein  38.52 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202407  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1147  hypothetical protein  37.64 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5534  protein of unknown function DUF1217  36.59 
 
 		 738 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5254  protein of unknown function DUF1217  33.59 
 
 		 727 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0969  hypothetical protein  37.27 
 
 		 727 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.685924  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2474  hypothetical protein  35.22 
 
 		 801 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.958646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0545  protein of unknown function DUF1217  35.5 
 
 		 1111 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000988824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0592  protein of unknown function DUF1217  34 
 
 		 1111 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.535986 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0479  hypothetical protein  29.82 
 
 		 822 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1710  hypothetical protein  32.03 
 
 		 472 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214563  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6502  hypothetical protein  42.99 
 
 		 429 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0654  protein of unknown function DUF1217  41.96 
 
 		 417 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.371018  normal  0.202735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4200  flagellar protein, putative  29.67 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.628591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4159  hypothetical protein  29.86 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0365541  normal  0.446399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0680  hypothetical protein  42.99 
 
 		 417 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0691  protein of unknown function DUF1217  42.06 
 
 		 417 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3881  flagellar basal-body rod protein FLGF  29.41 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0287836  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3358  protein of unknown function DUF1217  26.91 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6503  hypothetical protein  38.81 
 
 		 414 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0105  hypothetical protein  26.92 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2971  hypothetical protein  37.19 
 
 		 650 aa  85.9  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.123475 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1618  flagellar protein, putative  27.71 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3449  hypothetical protein  24.79 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.419129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>