94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2012 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  79.13 
 
 		 578 aa  852    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  100 
 
 		 572 aa  1107    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  38.75 
 
 		 620 aa  293  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  37.63 
 
 		 630 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  56.91 
 
 		 399 aa  189  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  55.8 
 
 		 399 aa  187  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  57.87 
 
 		 420 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  54.7 
 
 		 399 aa  183  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  54.14 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  48.51 
 
 		 762 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  46.89 
 
 		 693 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  42.16 
 
 		 1562 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  51.69 
 
 		 892 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  35.39 
 
 		 737 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  50.56 
 
 		 888 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  45.23 
 
 		 692 aa  169  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  49.44 
 
 		 888 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  48.17 
 
 		 400 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  51.72 
 
 		 522 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  36.32 
 
 		 746 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  47.24 
 
 		 886 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  53.18 
 
 		 735 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  50.29 
 
 		 886 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  48.92 
 
 		 405 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  48.92 
 
 		 405 aa  157  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  48.92 
 
 		 405 aa  156  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  48.09 
 
 		 405 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  48.39 
 
 		 405 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  47.98 
 
 		 753 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  43.62 
 
 		 432 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  48.55 
 
 		 375 aa  141  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  66.67 
 
 		 523 aa  134  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  51.55 
 
 		 514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  66.33 
 
 		 516 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  46.28 
 
 		 393 aa  128  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  40.61 
 
 		 528 aa  127  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  63.37 
 
 		 537 aa  126  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  62.38 
 
 		 536 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  52.34 
 
 		 523 aa  120  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  59.8 
 
 		 272 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  59.22 
 
 		 272 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  40 
 
 		 272 aa  115  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  59.22 
 
 		 272 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  36.28 
 
 		 272 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  39.41 
 
 		 272 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  53.21 
 
 		 275 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  46.92 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  37.3 
 
 		 289 aa  99  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  52.69 
 
 		 300 aa  95.5  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  45.83 
 
 		 547 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  27.52 
 
 		 585 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  27.19 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  30.95 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  29.76 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  38.31 
 
 		 461 aa  62  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  28.32 
 
 		 592 aa  62  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  37.66 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  25.35 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  34.88 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  25 
 
 		 320 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  28.65 
 
 		 260 aa  55.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  29.33 
 
 		 272 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  32.26 
 
 		 302 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  34.41 
 
 		 302 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  35.14 
 
 		 289 aa  54.3  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  29.61 
 
 		 277 aa  53.9  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  31.58 
 
 		 320 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  40.28 
 
 		 380 aa  52.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  27.85 
 
 		 273 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  31.18 
 
 		 302 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  24.06 
 
 		 320 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  32.61 
 
 		 302 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  37.5 
 
 		 389 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  28.42 
 
 		 320 aa  50.8  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  25.46 
 
 		 279 aa  50.4  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  34.69 
 
 		 439 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  32.61 
 
 		 303 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  37.5 
 
 		 311 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  34.15 
 
 		 395 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  32.65 
 
 		 303 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  33.77 
 
 		 395 aa  48.5  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  30.43 
 
 		 301 aa  47.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  30.25 
 
 		 389 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  32.1 
 
 		 395 aa  47  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  33.71 
 
 		 301 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  32.91 
 
 		 327 aa  45.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  32.12 
 
 		 582 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  38.57 
 
 		 311 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  24.42 
 
 		 274 aa  44.3  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  39.06 
 
 		 282 aa  43.9  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  26.84 
 
 		 293 aa  43.9  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  35.59 
 
 		 275 aa  43.9  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  34.72 
 
 		 321 aa  43.5  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  25.77 
 
 		 364 aa  43.9  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>