123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2551 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  100 
 
 		 375 aa  722    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  49.25 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  43.48 
 
 		 397 aa  246  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  44.33 
 
 		 399 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  42.17 
 
 		 405 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  42.26 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  42.26 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  41.2 
 
 		 405 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  40.62 
 
 		 405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  40.62 
 
 		 405 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  44.69 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  39.9 
 
 		 405 aa  226  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  38.66 
 
 		 432 aa  193  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  53.48 
 
 		 630 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  51.27 
 
 		 693 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  50.76 
 
 		 692 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  55.62 
 
 		 737 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  48.51 
 
 		 523 aa  166  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  57.49 
 
 		 522 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  56.29 
 
 		 516 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  54.49 
 
 		 886 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  55.69 
 
 		 514 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  50 
 
 		 762 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  54.76 
 
 		 536 aa  161  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  54.49 
 
 		 886 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  53.76 
 
 		 620 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  55.95 
 
 		 537 aa  159  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  54.76 
 
 		 528 aa  159  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  53.25 
 
 		 892 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  54.49 
 
 		 888 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  50.3 
 
 		 1562 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  53.01 
 
 		 753 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  52.69 
 
 		 888 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  48.02 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  50.58 
 
 		 578 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  43.5 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  52.69 
 
 		 746 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  42.22 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  42.04 
 
 		 272 aa  146  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  43.05 
 
 		 272 aa  146  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  54.49 
 
 		 735 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  48.55 
 
 		 572 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  42.15 
 
 		 272 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  42.15 
 
 		 272 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  44.1 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  47.02 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  42.22 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  46.2 
 
 		 275 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  58.25 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  41.12 
 
 		 547 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  28.36 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  33.14 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  30.95 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  31.33 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  30.51 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  34.73 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  34.34 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  29.52 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  30.46 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  34.15 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  33.59 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  31.67 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  30.59 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  29.83 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  45.05 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  33.68 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  36.56 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  30.17 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  36.56 
 
 		 269 aa  55.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  27.66 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  32.56 
 
 		 265 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  39.73 
 
 		 321 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  32.94 
 
 		 263 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  27.66 
 
 		 301 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  35.48 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  33.68 
 
 		 311 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  26.6 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  28.09 
 
 		 282 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  36.96 
 
 		 327 aa  53.1  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  32.95 
 
 		 263 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  27.39 
 
 		 592 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  30.84 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1452  flagellin-like  29.59 
 
 		 287 aa  51.2  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  28.9 
 
 		 277 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  26.73 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  24.06 
 
 		 321 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  34.07 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  25.63 
 
 		 303 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  32.93 
 
 		 284 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  29.51 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  30.58 
 
 		 590 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  25.93 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  29.55 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  33.11 
 
 		 516 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  36.9 
 
 		 461 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  32.96 
 
 		 293 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0622  flagellin domain-containing protein  27.81 
 
 		 266 aa  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  36.9 
 
 		 461 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  24.86 
 
 		 271 aa  47.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  28.14 
 
 		 585 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>