101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1194 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  85.25 
 
 
399 aa  641    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  100 
 
 
400 aa  758    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  83.5 
 
 
399 aa  631  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  81.75 
 
 
397 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  79.75 
 
 
399 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  60.44 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  60.44 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  60.92 
 
 
405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  59.12 
 
 
405 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  60.19 
 
 
405 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  54.07 
 
 
420 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  48.53 
 
 
432 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  42.34 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  44.83 
 
 
375 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  57.14 
 
 
620 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  54 
 
 
1562 aa  180  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  52.74 
 
 
693 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  54.7 
 
 
578 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  50.75 
 
 
692 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  50 
 
 
630 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  51.93 
 
 
572 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  55.06 
 
 
886 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  53.93 
 
 
886 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  42.35 
 
 
523 aa  169  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  54.89 
 
 
892 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  53.8 
 
 
888 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  53.89 
 
 
762 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  45.59 
 
 
737 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  55.62 
 
 
528 aa  166  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  42.91 
 
 
523 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  53.07 
 
 
888 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  51.67 
 
 
753 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  54.49 
 
 
514 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  54.19 
 
 
536 aa  157  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  54.49 
 
 
522 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  52.51 
 
 
537 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  53.37 
 
 
516 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  54.75 
 
 
746 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  44.88 
 
 
735 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  41.62 
 
 
272 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  41.08 
 
 
272 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  42.13 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  41.18 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  41.62 
 
 
272 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  40 
 
 
272 aa  112  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  40.5 
 
 
300 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  36.9 
 
 
289 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  38.95 
 
 
275 aa  103  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  38.71 
 
 
275 aa  99.8  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  43.24 
 
 
547 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  29.41 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  29.15 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  30.73 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  32.22 
 
 
260 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  28.78 
 
 
303 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  30.73 
 
 
274 aa  64.7  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  29.33 
 
 
282 aa  64.7  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  33.14 
 
 
273 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  28.99 
 
 
301 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  26.7 
 
 
321 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  30.9 
 
 
275 aa  63.5  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  26.54 
 
 
302 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  28.43 
 
 
301 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  27.37 
 
 
277 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  33.71 
 
 
273 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  28.64 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  27.75 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  28.85 
 
 
302 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  40.54 
 
 
320 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  28.68 
 
 
320 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  38.46 
 
 
380 aa  59.7  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  27.93 
 
 
274 aa  57.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  27.49 
 
 
292 aa  57.4  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  50 
 
 
272 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  29.49 
 
 
289 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  27.57 
 
 
311 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  31.11 
 
 
321 aa  53.5  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  34.07 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  35.71 
 
 
395 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  30.91 
 
 
273 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  24.21 
 
 
282 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  22.65 
 
 
395 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  27.98 
 
 
293 aa  50.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  29.79 
 
 
585 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0102  flagellin domain protein  24.88 
 
 
276 aa  49.7  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  31.78 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2989  flagellin  30.51 
 
 
272 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000626303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  28.81 
 
 
592 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  26.63 
 
 
281 aa  47.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  24.04 
 
 
281 aa  46.6  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  41.89 
 
 
311 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  35.16 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  32.97 
 
 
292 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  28.77 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  35 
 
 
389 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  31.94 
 
 
271 aa  43.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  31.94 
 
 
271 aa  43.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  37.93 
 
 
516 aa  43.1  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  28.81 
 
 
582 aa  43.1  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  29.46 
 
 
327 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>