87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1336 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  100 
 
 		 528 aa  997    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  64.25 
 
 		 523 aa  545  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  61.85 
 
 		 514 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  61.48 
 
 		 522 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  58.9 
 
 		 523 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  60.71 
 
 		 516 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  61.51 
 
 		 537 aa  513  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  59.93 
 
 		 536 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  71.05 
 
 		 737 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  65.53 
 
 		 762 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  60.24 
 
 		 888 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  61.38 
 
 		 892 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  66.92 
 
 		 886 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  60.37 
 
 		 888 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  69.58 
 
 		 735 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  65.38 
 
 		 746 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  64.26 
 
 		 886 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  62.89 
 
 		 753 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  38.54 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  38.38 
 
 		 572 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  47.42 
 
 		 1562 aa  203  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  49.11 
 
 		 693 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  48.04 
 
 		 692 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  48.53 
 
 		 620 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  47.21 
 
 		 630 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  57.22 
 
 		 405 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  57.22 
 
 		 405 aa  170  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  57.22 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  53.93 
 
 		 399 aa  166  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  55.37 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  54.8 
 
 		 405 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  53.93 
 
 		 397 aa  163  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  53.93 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  53.37 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  44.78 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  43.38 
 
 		 375 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  51.58 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  55.62 
 
 		 400 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  40 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  41.54 
 
 		 300 aa  119  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  37.38 
 
 		 272 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  39.2 
 
 		 272 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  42.51 
 
 		 275 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  37.38 
 
 		 272 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  38.19 
 
 		 272 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  39.36 
 
 		 275 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  37.02 
 
 		 272 aa  104  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  36.54 
 
 		 272 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  32.62 
 
 		 289 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  45.26 
 
 		 547 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  33.13 
 
 		 273 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  31.33 
 
 		 273 aa  69.3  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  30.88 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  30.15 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  30.72 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  27.98 
 
 		 275 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  30.13 
 
 		 273 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  33.33 
 
 		 320 aa  54.7  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  27.72 
 
 		 293 aa  54.3  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  33.33 
 
 		 320 aa  53.9  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  29.82 
 
 		 292 aa  53.5  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  23.81 
 
 		 302 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  34.18 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  34.58 
 
 		 320 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  26.63 
 
 		 274 aa  52  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  31.65 
 
 		 321 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  31.31 
 
 		 395 aa  50.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  33.33 
 
 		 302 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  31.96 
 
 		 302 aa  50.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  36.36 
 
 		 395 aa  50.4  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  27.01 
 
 		 279 aa  50.4  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  32.31 
 
 		 389 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  36.11 
 
 		 311 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  35.06 
 
 		 395 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  25.58 
 
 		 277 aa  48.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  30.93 
 
 		 302 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  23.95 
 
 		 274 aa  47.8  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  27.14 
 
 		 277 aa  47.4  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  26.4 
 
 		 301 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  26.9 
 
 		 301 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  33.33 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  37.33 
 
 		 281 aa  46.2  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  32.88 
 
 		 282 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  34.25 
 
 		 282 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0101  flagellin domain protein  33.33 
 
 		 273 aa  44.3  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  32.97 
 
 		 320 aa  43.5  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  29.57 
 
 		 327 aa  43.5  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>