98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1670 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  64.05 
 
 		 892 aa  651    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  60.67 
 
 		 737 aa  775    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  100 
 
 		 762 aa  1432    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  62.29 
 
 		 888 aa  674    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  63.67 
 
 		 888 aa  643    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  60.91 
 
 		 735 aa  756    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  63.42 
 
 		 746 aa  781    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  63.87 
 
 		 753 aa  783    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  61.73 
 
 		 886 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  61.61 
 
 		 886 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  63.75 
 
 		 523 aa  355  1e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  57.87 
 
 		 523 aa  343  9e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  69.92 
 
 		 528 aa  327  6e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  52.68 
 
 		 536 aa  326  8.000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  53.68 
 
 		 537 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  53.1 
 
 		 522 aa  312  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  49.27 
 
 		 514 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  52.57 
 
 		 516 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  47.4 
 
 		 1562 aa  218  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  47.24 
 
 		 620 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  36.96 
 
 		 630 aa  178  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  52.6 
 
 		 578 aa  177  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  52.58 
 
 		 420 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  57.63 
 
 		 405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  57.63 
 
 		 405 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  55.93 
 
 		 405 aa  174  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  53.89 
 
 		 399 aa  174  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  50.87 
 
 		 572 aa  173  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  55.93 
 
 		 405 aa  173  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  52.78 
 
 		 399 aa  172  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  53.67 
 
 		 405 aa  168  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  53.33 
 
 		 399 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  52.78 
 
 		 397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  50 
 
 		 375 aa  163  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  44.01 
 
 		 432 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  53.89 
 
 		 400 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  46.86 
 
 		 393 aa  150  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  58.27 
 
 		 693 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  57.26 
 
 		 692 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  42.49 
 
 		 300 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  42.51 
 
 		 272 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  40.12 
 
 		 272 aa  112  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  42.51 
 
 		 272 aa  111  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  41.32 
 
 		 272 aa  110  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  39.52 
 
 		 272 aa  109  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  40.72 
 
 		 272 aa  108  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  41.25 
 
 		 275 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  39.13 
 
 		 275 aa  103  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  34.95 
 
 		 289 aa  97.8  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  42.11 
 
 		 547 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  33.94 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  31.52 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  31.21 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  32.9 
 
 		 273 aa  60.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  59.3  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  30.32 
 
 		 289 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  28.48 
 
 		 275 aa  55.8  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  27.64 
 
 		 302 aa  55.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  32.69 
 
 		 320 aa  55.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  26.9 
 
 		 302 aa  54.3  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  29.17 
 
 		 279 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  31.91 
 
 		 320 aa  53.9  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  31.91 
 
 		 320 aa  53.9  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  27.92 
 
 		 274 aa  52.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  28.82 
 
 		 292 aa  53.5  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  27.22 
 
 		 274 aa  52.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  27.37 
 
 		 277 aa  52.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  34.78 
 
 		 395 aa  52  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  27.92 
 
 		 301 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  29.29 
 
 		 301 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3817  hypothetical protein  35.82 
 
 		 598 aa  51.6  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  30 
 
 		 293 aa  51.6  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  34.26 
 
 		 320 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  32.88 
 
 		 321 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  28.5 
 
 		 302 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  38.89 
 
 		 389 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  36.36 
 
 		 395 aa  50.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  37.5 
 
 		 311 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  29.15 
 
 		 302 aa  49.3  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3196  flagellin  31.18 
 
 		 383 aa  48.5  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  32.61 
 
 		 395 aa  48.5  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  34.44 
 
 		 380 aa  47.8  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  30 
 
 		 281 aa  47.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  23.22 
 
 		 320 aa  47.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  27.78 
 
 		 303 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  37.89 
 
 		 388 aa  45.8  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  37.89 
 
 		 388 aa  45.8  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  37.89 
 
 		 388 aa  45.8  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3952  flagellin  37.89 
 
 		 388 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  37.89 
 
 		 388 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  37.89 
 
 		 388 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3448  flagellin  37.89 
 
 		 388 aa  45.8  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0953619  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 		 439 aa  45.8  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0622  flagellin domain-containing protein  40.68 
 
 		 266 aa  45.4  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  29.17 
 
 		 282 aa  45.4  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  29.55 
 
 		 585 aa  45.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  34.25 
 
 		 282 aa  45.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  26.04 
 
 		 277 aa  44.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>