106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3814 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3800  flagellin  65.17 
 
 
886 aa  982    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  100 
 
 
888 aa  1665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  64.66 
 
 
762 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  81.28 
 
 
892 aa  1305    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  67.64 
 
 
886 aa  1029    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  89.08 
 
 
888 aa  1481    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  60.36 
 
 
737 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  61 
 
 
735 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  62.9 
 
 
753 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  64.94 
 
 
746 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  56.27 
 
 
523 aa  356  8.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  55.67 
 
 
523 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  65.7 
 
 
528 aa  320  5e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  51.36 
 
 
536 aa  318  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  52.99 
 
 
537 aa  310  6.999999999999999e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  51.99 
 
 
514 aa  303  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  51.99 
 
 
522 aa  302  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  51.99 
 
 
516 aa  301  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  46.34 
 
 
1562 aa  205  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  46.91 
 
 
693 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  46.25 
 
 
692 aa  195  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  37.5 
 
 
630 aa  177  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  39.49 
 
 
620 aa  177  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  54.19 
 
 
399 aa  169  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  54.19 
 
 
399 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  50.75 
 
 
420 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  49.71 
 
 
572 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  54.19 
 
 
399 aa  164  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  49.71 
 
 
578 aa  163  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  53.67 
 
 
405 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  53.07 
 
 
397 aa  162  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  53.67 
 
 
405 aa  162  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  52.54 
 
 
405 aa  161  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  51.41 
 
 
405 aa  159  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  49.01 
 
 
375 aa  157  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  50.28 
 
 
405 aa  157  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  54.44 
 
 
400 aa  153  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  42.09 
 
 
432 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  46.15 
 
 
393 aa  144  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  41.45 
 
 
300 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  42.03 
 
 
275 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  44.38 
 
 
275 aa  111  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  43.11 
 
 
272 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  43.11 
 
 
272 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  38.6 
 
 
272 aa  108  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  38.32 
 
 
272 aa  107  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  57.58 
 
 
272 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  37.43 
 
 
272 aa  105  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  33.7 
 
 
289 aa  92  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  40.37 
 
 
547 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 
273 aa  66.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  30.99 
 
 
260 aa  62.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  31.52 
 
 
273 aa  62  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3817  hypothetical protein  47.78 
 
 
598 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  30.99 
 
 
279 aa  59.7  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  29.76 
 
 
275 aa  57  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  29.44 
 
 
301 aa  57.4  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  32.73 
 
 
272 aa  56.6  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  27.91 
 
 
277 aa  55.5  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  28.93 
 
 
301 aa  55.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  28.99 
 
 
274 aa  54.3  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  27.65 
 
 
292 aa  53.5  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  26.9 
 
 
302 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  27.41 
 
 
302 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  34.16 
 
 
273 aa  52.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  34.78 
 
 
395 aa  52  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  33.33 
 
 
302 aa  52  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  29.63 
 
 
289 aa  51.6  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  35.56 
 
 
389 aa  50.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  37.14 
 
 
320 aa  50.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  33.7 
 
 
395 aa  50.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  36.36 
 
 
395 aa  50.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  34.18 
 
 
320 aa  49.3  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  34.18 
 
 
320 aa  48.9  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  35.9 
 
 
311 aa  48.9  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  26.4 
 
 
302 aa  48.9  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0612  flagellar hook-associated protein 3  23.1 
 
 
417 aa  48.1  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.403095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4455  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40 
 
 
598 aa  48.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  30.26 
 
 
305 aa  48.1  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3196  flagellin  33.33 
 
 
383 aa  47.8  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  37.5 
 
 
380 aa  47.8  0.0009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  30.68 
 
 
585 aa  47.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  34.72 
 
 
320 aa  47  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  32.64 
 
 
388 aa  46.6  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  32.64 
 
 
388 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  25.15 
 
 
274 aa  46.6  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3448  flagellin  32.64 
 
 
388 aa  46.6  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0953619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  32.64 
 
 
388 aa  46.6  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  32.64 
 
 
388 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3952  flagellin  32.64 
 
 
388 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  32.64 
 
 
388 aa  46.6  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0622  flagellin domain-containing protein  43.1 
 
 
266 aa  47  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  31.43 
 
 
321 aa  46.6  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  28.18 
 
 
293 aa  45.8  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  31.31 
 
 
303 aa  45.8  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0372  flagellin  31.78 
 
 
573 aa  45.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  32.18 
 
 
303 aa  45.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0163  flagellin  33.91 
 
 
569 aa  45.4  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.649103  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1528  flagellin  34.85 
 
 
573 aa  45.1  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  33.7 
 
 
327 aa  45.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>