81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3292 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  485  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  37.63 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  31.02 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  31.39 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  31.39 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  31.02 
 
 		 272 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  29.56 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  30.91 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  30.58 
 
 		 275 aa  99  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  29.24 
 
 		 275 aa  95.9  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  29.61 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  33.9 
 
 		 1562 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  35.03 
 
 		 693 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  33.9 
 
 		 630 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  33.33 
 
 		 692 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  31.32 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  31.32 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  30.94 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  32.77 
 
 		 620 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  30.94 
 
 		 405 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  31.84 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  30.77 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  32.75 
 
 		 892 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  31.58 
 
 		 536 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  32.95 
 
 		 737 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  30.46 
 
 		 522 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  33.14 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  31.52 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  30.64 
 
 		 537 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  30.23 
 
 		 516 aa  75.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  31.4 
 
 		 514 aa  75.5  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  32.95 
 
 		 528 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  30.99 
 
 		 888 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  29.82 
 
 		 886 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  30.94 
 
 		 523 aa  73.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  30.99 
 
 		 886 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  30.73 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  31.21 
 
 		 888 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  30.41 
 
 		 753 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  31.21 
 
 		 762 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  32.22 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  28.25 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  29.95 
 
 		 746 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  30.64 
 
 		 735 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  29.38 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  31.87 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  29.28 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  28.65 
 
 		 572 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  28.73 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  28.65 
 
 		 578 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  39.53 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  25 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  25.75 
 
 		 547 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  27.56 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  38.37 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  36.05 
 
 		 320 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  27.23 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  33.72 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  25.84 
 
 		 302 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  34.88 
 
 		 395 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  26.73 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  28.64 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  28.96 
 
 		 292 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  33.72 
 
 		 395 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  25.22 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  31.96 
 
 		 321 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  33.01 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  28.11 
 
 		 282 aa  48.9  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  27.23 
 
 		 281 aa  48.9  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  26.67 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  35.21 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  23.72 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  27.23 
 
 		 293 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  28.31 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  22.91 
 
 		 302 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  29.07 
 
 		 320 aa  46.2  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2216  hypothetical protein  32.47 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  26.32 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  23.15 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  30.12 
 
 		 395 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  31.33 
 
 		 327 aa  42  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>