More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4714 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4714  flagellin domain protein  100 
 
 		 273 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0875271 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4750  flagellin domain protein  84.98 
 
 		 273 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250606 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3673  flagellin domain protein  84.98 
 
 		 273 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0474739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0382  flagellin protein  83.15 
 
 		 273 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.768637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  44.04 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  41.99 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  42.5 
 
 		 279 aa  191  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  44.21 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  42.65 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  41.67 
 
 		 278 aa  186  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  40.22 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  42.45 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  42.11 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  42.31 
 
 		 288 aa  178  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  40.64 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  42.55 
 
 		 282 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  41.03 
 
 		 272 aa  175  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  39.31 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2989  flagellin  40.51 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000626303 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  41.33 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  42.25 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  39.93 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  40.22 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  40.07 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  41.81 
 
 		 290 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  40.07 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  40.88 
 
 		 271 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  40.88 
 
 		 271 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  42.75 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  39.42 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  38.46 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  41.39 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  40.88 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  40.88 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  39.02 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  39.05 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1284  flagellin domain-containing protein  41.7 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0077  flagellin domain-containing protein  38.41 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104255 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  40.46 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  40.99 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  40.22 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  41.39 
 
 		 272 aa  168  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  38.6 
 
 		 263 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  38.97 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  40.44 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  41.24 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  41.03 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  37.96 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  39.78 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  39.78 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  38.49 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1283  flagellin domain-containing protein  40.96 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  41.11 
 
 		 278 aa  166  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  39.05 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  39.05 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  39.19 
 
 		 272 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  40.51 
 
 		 272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  39.85 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  40.66 
 
 		 273 aa  165  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  37.72 
 
 		 274 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  40.78 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  40.88 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  39.48 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  38.6 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  36.46 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3343  flagellin  40.15 
 
 		 272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  38.69 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  39.11 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  37.32 
 
 		 279 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  37.73 
 
 		 273 aa  161  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  37.32 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  38.32 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  36.97 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  37.45 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  37.41 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  38.13 
 
 		 274 aa  159  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  37.5 
 
 		 273 aa  158  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  38.83 
 
 		 273 aa  158  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  37.54 
 
 		 294 aa  158  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  37.55 
 
 		 276 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  38.21 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0169  flagellin  39.13 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521055  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  37.82 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0156  flagellin  39.13 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  38.21 
 
 		 278 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  38.04 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  37.86 
 
 		 275 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4095  flagellin domain-containing protein  40.79 
 
 		 276 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  36.52 
 
 		 278 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  36.63 
 
 		 266 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2950  flagellin domain protein  34.46 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0676667 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  36.76 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  35.47 
 
 		 295 aa  149  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0062  flagellin domain-containing protein  36.86 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  36.39 
 
 		 289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  39.63 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  38.6 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0151  flagellin D  37.46 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  36.76 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  32.92 
 
 		 319 aa  145  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>