More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3673 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3673  flagellin domain protein  100 
 
 
273 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0474739  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4750  flagellin domain protein  100 
 
 
273 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250606 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4714  flagellin domain protein  84.98 
 
 
273 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0875271 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0382  flagellin protein  87.18 
 
 
273 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.768637  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  41.16 
 
 
276 aa  202  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  42.65 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  44.79 
 
 
285 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  41.58 
 
 
279 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  42.75 
 
 
273 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  40.73 
 
 
278 aa  188  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  41.18 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  43.71 
 
 
288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  41.22 
 
 
280 aa  183  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  41.73 
 
 
276 aa  182  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1284  flagellin domain-containing protein  43.68 
 
 
273 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  39.93 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  40.85 
 
 
287 aa  179  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  39.93 
 
 
286 aa  178  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  43.64 
 
 
278 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1283  flagellin domain-containing protein  43.75 
 
 
273 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  40.68 
 
 
272 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  41.24 
 
 
290 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  39.71 
 
 
273 aa  176  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0077  flagellin domain-containing protein  39.13 
 
 
274 aa  175  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  40.44 
 
 
262 aa  175  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2989  flagellin  40.86 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000626303 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  38.97 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  38.97 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  40 
 
 
272 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  38.49 
 
 
271 aa  172  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  36.52 
 
 
287 aa  172  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  39.57 
 
 
271 aa  172  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  38.01 
 
 
271 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  41.2 
 
 
283 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  39.48 
 
 
270 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  38.97 
 
 
272 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  38.01 
 
 
271 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  40.36 
 
 
271 aa  170  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  38.49 
 
 
271 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  39.19 
 
 
272 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  39.34 
 
 
263 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  39.69 
 
 
272 aa  169  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  40.42 
 
 
278 aa  168  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  38.18 
 
 
273 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  41.34 
 
 
283 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  37.77 
 
 
277 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  37.5 
 
 
272 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  40.78 
 
 
282 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  38.1 
 
 
273 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  37.5 
 
 
272 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  37.5 
 
 
273 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  38.91 
 
 
274 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  37.87 
 
 
272 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  41.55 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  38.38 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  38.24 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  38.24 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  39.78 
 
 
275 aa  166  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  38.1 
 
 
272 aa  166  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  40.66 
 
 
272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  38.24 
 
 
272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  40 
 
 
273 aa  165  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  40.44 
 
 
271 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  38.32 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  37.73 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  37.73 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  38.99 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  39.13 
 
 
314 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  38.55 
 
 
274 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  40.07 
 
 
271 aa  163  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  37.68 
 
 
279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  37.96 
 
 
275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4095  flagellin domain-containing protein  42.24 
 
 
276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  37.5 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  37.01 
 
 
274 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  38.18 
 
 
273 aa  162  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  39.71 
 
 
271 aa  162  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  36.4 
 
 
273 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  39.36 
 
 
278 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  37.97 
 
 
294 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  37.32 
 
 
279 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0156  flagellin  40.71 
 
 
274 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447267  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  38.55 
 
 
272 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0169  flagellin  40.71 
 
 
274 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521055  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  37.5 
 
 
273 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  39.07 
 
 
275 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  39.01 
 
 
278 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3343  flagellin  40.07 
 
 
272 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  38.3 
 
 
278 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  37.1 
 
 
274 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  35.66 
 
 
263 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  39.05 
 
 
265 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1583  flagellin domain-containing protein  37.23 
 
 
278 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260385  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  36.61 
 
 
295 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  36.39 
 
 
294 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0062  flagellin domain-containing protein  37.65 
 
 
256 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1581  flagellin domain-containing protein  37.37 
 
 
280 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014777  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2361  flagellin-like  34.26 
 
 
327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1582  flagellin domain-containing protein  37.19 
 
 
281 aa  152  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  36.73 
 
 
289 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>