More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0163 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1339  flagellin  73.66 
 
 
576 aa  811    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1526  flagellin  72.02 
 
 
573 aa  780    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.227126  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1528  flagellin  72.54 
 
 
573 aa  785    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0372  flagellin  72.52 
 
 
573 aa  781    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0163  flagellin  100 
 
 
569 aa  1115    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.649103  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1338  flagellin  73.66 
 
 
576 aa  809    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0164  flagellin  90.51 
 
 
569 aa  1028    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2297  flagellin B  51.14 
 
 
499 aa  477  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1636  flagellin B  48.21 
 
 
518 aa  450  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1635  flagellin B  48.55 
 
 
519 aa  448  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0568  flagellin B  58.87 
 
 
496 aa  403  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2229  flagellin domain protein  49.75 
 
 
481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0173  flagellin-like  57.65 
 
 
392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0172  flagellin-like  58.24 
 
 
392 aa  195  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  37.84 
 
 
609 aa  160  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  36.81 
 
 
497 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  39.2 
 
 
492 aa  151  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  27.78 
 
 
580 aa  148  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  33.79 
 
 
492 aa  147  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  44.94 
 
 
272 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  36.28 
 
 
501 aa  144  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  35.44 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  35.31 
 
 
475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1705  flagellin domain-containing protein  31.95 
 
 
493 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000174414 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  48.15 
 
 
490 aa  140  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0069  flagellar filament protein  31.69 
 
 
493 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  46.91 
 
 
492 aa  139  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  34.64 
 
 
462 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  44.44 
 
 
272 aa  136  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  44.44 
 
 
272 aa  136  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  45.03 
 
 
271 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  45.03 
 
 
271 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  48.52 
 
 
294 aa  136  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  33.63 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  45.51 
 
 
380 aa  135  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  45.61 
 
 
506 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  31.52 
 
 
498 aa  134  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  38.52 
 
 
404 aa  134  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  45.68 
 
 
492 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  33.94 
 
 
481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  41.62 
 
 
485 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  45.93 
 
 
278 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  41.04 
 
 
484 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 
482 aa  130  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  34.44 
 
 
516 aa  130  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  43.27 
 
 
271 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  43.27 
 
 
271 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  45.35 
 
 
278 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  45.62 
 
 
494 aa  130  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  42.55 
 
 
272 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  39.15 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  42.77 
 
 
276 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  44.12 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  43.53 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  42.59 
 
 
277 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  44.19 
 
 
278 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  42.69 
 
 
271 aa  127  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  42.69 
 
 
271 aa  127  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  32.95 
 
 
488 aa  126  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  43.6 
 
 
273 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  40.83 
 
 
420 aa  125  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  41.18 
 
 
393 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  41.14 
 
 
387 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  42.53 
 
 
276 aa  124  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  43.31 
 
 
294 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  32.73 
 
 
471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  40.59 
 
 
394 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  40.24 
 
 
383 aa  122  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  42.44 
 
 
273 aa  121  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  41.28 
 
 
273 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2200  flagellin FliC  42.59 
 
 
587 aa  121  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0113  flagellin domain protein  41.48 
 
 
277 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.232529  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  42.86 
 
 
378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  37.93 
 
 
387 aa  120  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  35.94 
 
 
404 aa  120  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  42.44 
 
 
272 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  40.78 
 
 
270 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  43.95 
 
 
687 aa  120  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  30.35 
 
 
472 aa  120  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  40.23 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0198  flagellin-like protein  46.32 
 
 
936 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  32.22 
 
 
488 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  40.8 
 
 
272 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  40.23 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  43.31 
 
 
405 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  42.33 
 
 
273 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  41.86 
 
 
272 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  35.37 
 
 
377 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  41.28 
 
 
272 aa  119  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  42.59 
 
 
279 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  45 
 
 
389 aa  118  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  35.51 
 
 
486 aa  118  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  41.86 
 
 
274 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  42.59 
 
 
272 aa  118  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  38.22 
 
 
273 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  41.98 
 
 
279 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  45.03 
 
 
283 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  41.98 
 
 
279 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  40.34 
 
 
379 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  43.64 
 
 
280 aa  117  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>