More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0164 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0372  flagellin  70.61 
 
 
573 aa  768    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1526  flagellin  72.88 
 
 
573 aa  796    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.227126  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1528  flagellin  69.78 
 
 
573 aa  763    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0164  flagellin  100 
 
 
569 aa  1123    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1338  flagellin  74.35 
 
 
576 aa  820    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1339  flagellin  72.62 
 
 
576 aa  798    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0163  flagellin  90.51 
 
 
569 aa  1028    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.649103  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2297  flagellin B  50.61 
 
 
499 aa  480  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1635  flagellin B  50.09 
 
 
519 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1636  flagellin B  49.06 
 
 
518 aa  458  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0568  flagellin B  59.33 
 
 
496 aa  409  1e-113  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2229  flagellin domain protein  46.48 
 
 
481 aa  396  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  32.47 
 
 
497 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0173  flagellin-like  62.94 
 
 
392 aa  212  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0172  flagellin-like  62.94 
 
 
392 aa  205  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  27.75 
 
 
580 aa  157  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  36.64 
 
 
609 aa  153  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  44.94 
 
 
272 aa  146  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  33.43 
 
 
492 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  47.31 
 
 
380 aa  141  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  34.29 
 
 
492 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  34.35 
 
 
475 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1705  flagellin domain-containing protein  33.54 
 
 
493 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000174414 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  33.8 
 
 
462 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  34.35 
 
 
475 aa  138  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0069  flagellar filament protein  33.23 
 
 
493 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  34.65 
 
 
501 aa  136  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  45.68 
 
 
277 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  34.47 
 
 
490 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  32.82 
 
 
493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  43.2 
 
 
420 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  31.52 
 
 
498 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  41.76 
 
 
492 aa  131  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  46.5 
 
 
294 aa  131  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  33.74 
 
 
517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  32.43 
 
 
481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  34.35 
 
 
516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  42.11 
 
 
272 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  42.6 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  42.11 
 
 
272 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  42.69 
 
 
271 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  42.69 
 
 
271 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0198  flagellin-like protein  48.53 
 
 
936 aa  127  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  41.18 
 
 
494 aa  127  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  43.21 
 
 
492 aa  127  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2200  flagellin FliC  43.83 
 
 
587 aa  126  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  40.46 
 
 
485 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  31.83 
 
 
482 aa  126  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  44.38 
 
 
506 aa  126  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  39.88 
 
 
484 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  39.88 
 
 
276 aa  124  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  46.43 
 
 
389 aa  124  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2114  flagellin  25.65 
 
 
506 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.168497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  40.84 
 
 
273 aa  123  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  34.94 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  39.47 
 
 
278 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  42 
 
 
376 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  40.94 
 
 
271 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  36.08 
 
 
404 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  38.95 
 
 
278 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  40.94 
 
 
271 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  47.26 
 
 
387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  40.23 
 
 
276 aa  121  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0113  flagellin domain protein  45.45 
 
 
277 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.232529  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  39.43 
 
 
278 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  38.83 
 
 
272 aa  120  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  40.83 
 
 
272 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  40.59 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0168  flagellin domain-containing protein  47.1 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  40.23 
 
 
377 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  38.1 
 
 
391 aa  119  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  40.23 
 
 
377 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  31.16 
 
 
488 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  39.08 
 
 
272 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  40.35 
 
 
271 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  42.04 
 
 
294 aa  118  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  44.81 
 
 
386 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  40.35 
 
 
271 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  40.23 
 
 
378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  42.17 
 
 
376 aa  117  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  45.71 
 
 
386 aa  117  5e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  38.82 
 
 
393 aa  117  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  40 
 
 
468 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0539  flagellin domain-containing protein  45.71 
 
 
387 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  40.12 
 
 
327 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  34.93 
 
 
377 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  34.58 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  42.04 
 
 
263 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  39.11 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  40.56 
 
 
404 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3036  flagellin domain protein  44.76 
 
 
799 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  37.71 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  38.24 
 
 
394 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  37.77 
 
 
263 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2998  flagellin domain protein  43.71 
 
 
391 aa  115  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  31.14 
 
 
488 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  41.36 
 
 
272 aa  115  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  38.15 
 
 
282 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  39.2 
 
 
379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  40.96 
 
 
376 aa  114  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>