More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0097 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  73.74 
 
 		 736 aa  931    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3794  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  72.88 
 
 		 708 aa  947    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4196  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  74.96 
 
 		 693 aa  959    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0097  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 720 aa  1428    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  67.41 
 
 		 826 aa  547  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  66.67 
 
 		 742 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0144  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  67.68 
 
 		 764 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.131271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  67 
 
 		 814 aa  529  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  66.84 
 
 		 837 aa  515  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  64.63 
 
 		 1059 aa  515  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  62.86 
 
 		 703 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  64.89 
 
 		 809 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  64.97 
 
 		 946 aa  505  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2970  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  63.61 
 
 		 584 aa  502  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  64.41 
 
 		 1011 aa  502  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  65.12 
 
 		 783 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4421  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  65.12 
 
 		 783 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  65.05 
 
 		 785 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  66.23 
 
 		 581 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  63.43 
 
 		 1057 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  64.32 
 
 		 899 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  61.07 
 
 		 888 aa  488  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  60.91 
 
 		 1014 aa  488  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  62.98 
 
 		 944 aa  485  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  64.32 
 
 		 1076 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  64.08 
 
 		 943 aa  479  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  60.84 
 
 		 638 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  59.95 
 
 		 946 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.4 
 
 		 585 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4475  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.18 
 
 		 587 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4107  PAS sensor protein  57.18 
 
 		 587 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0508  histidine kinase  56.44 
 
 		 632 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3343  histidine kinase  56.44 
 
 		 632 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.64 
 
 		 732 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  56.69 
 
 		 727 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5223  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.86 
 
 		 722 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  56.59 
 
 		 727 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.62 
 
 		 727 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  58.52 
 
 		 1224 aa  445  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.49 
 
 		 684 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3622  PAS sensor protein  57.11 
 
 		 684 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.86 
 
 		 942 aa  435  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  58.03 
 
 		 821 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.3 
 
 		 822 aa  422  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.26 
 
 		 795 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  58.98 
 
 		 812 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0232  sensor histidine kinase  54.88 
 
 		 716 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4293  sensory box histidine kinase/response regulator  49.29 
 
 		 793 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3996  PAS  49.41 
 
 		 796 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447634  normal  0.187563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  53.33 
 
 		 1427 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.35 
 
 		 1415 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.79 
 
 		 1426 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0855  GAF sensor hybrid histidine kinase  48.53 
 
 		 776 aa  359  8e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  52.64 
 
 		 1299 aa  356  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 		 630 aa  292  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  42.54 
 
 		 571 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 905 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.27 
 
 		 705 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  41.69 
 
 		 1036 aa  280  8e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.94 
 
 		 807 aa  276  7e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 1036 aa  273  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.86 
 
 		 508 aa  273  8.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 		 575 aa  273  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.16 
 
 		 712 aa  272  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.113069  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0349  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 		 722 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.081308  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 		 949 aa  271  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 		 966 aa  270  5.9999999999999995e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0134  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.49 
 
 		 682 aa  269  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574481  normal  0.0374693 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 887 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 		 943 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  40.62 
 
 		 949 aa  268  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0018  ATPase domain-containing protein  42.08 
 
 		 681 aa  266  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 		 702 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2399  histidine kinase  41.49 
 
 		 564 aa  266  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 		 704 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.08 
 
 		 681 aa  266  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.746553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  40.7 
 
 		 575 aa  266  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 		 703 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0038  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 		 681 aa  265  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0323591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 		 806 aa  264  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0137  sensory box histidine kinase/response regulator  39.73 
 
 		 611 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0024  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.37 
 
 		 734 aa  264  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1307  sensory box histidine kinase/response regulator  39.73 
 
 		 611 aa  264  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0163  sensory box histidine kinase/response regulator  39.54 
 
 		 611 aa  263  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  40.67 
 
 		 573 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 		 589 aa  263  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4726  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 		 625 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2778  Signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 611 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1041  sensory box histidine kinase/response regulator  39.5 
 
 		 611 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 727 aa  262  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 548 aa  262  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 		 762 aa  262  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2635  sensory box histidine kinase/response regulator  39.5 
 
 		 611 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 		 589 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.46 
 
 		 707 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5205  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.51 
 
 		 727 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5110  histidine kinase  40.1 
 
 		 558 aa  259  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  0.0814675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 926 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 		 732 aa  259  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4711  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 		 683 aa  258  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>