More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0811 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  68.62 
 
 		 191 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  66.84 
 
 		 194 aa  260  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  66.84 
 
 		 195 aa  260  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  58.38 
 
 		 205 aa  226  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  62.57 
 
 		 188 aa  203  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  43.67 
 
 		 189 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 196 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 216 aa  117  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 198 aa  110  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 189 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 198 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  37.69 
 
 		 179 aa  97.8  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 192 aa  95.9  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 195 aa  91.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 165 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
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NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  30.64 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  26.78 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 600 aa  79.7  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  27.06 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 179 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  27.88 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  25.7 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 167 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4468  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  29.67 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  25.86 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
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NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
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NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036521 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
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NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
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