More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0701 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  100 
 
 		 389 aa  770    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  91.76 
 
 		 386 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  67.74 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  71.54 
 
 		 379 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  70.21 
 
 		 382 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  70.21 
 
 		 382 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  51.24 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  53.54 
 
 		 383 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  54.36 
 
 		 385 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  51.4 
 
 		 383 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  52.06 
 
 		 368 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  52.73 
 
 		 389 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  51.69 
 
 		 382 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  51.94 
 
 		 390 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  52.68 
 
 		 379 aa  352  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  49.35 
 
 		 389 aa  350  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  47.65 
 
 		 398 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  46.13 
 
 		 407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  38.24 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  41.15 
 
 		 376 aa  257  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  39.57 
 
 		 403 aa  249  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  39.58 
 
 		 367 aa  249  7e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  40.11 
 
 		 384 aa  246  6.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  41.04 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  41.71 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  39.66 
 
 		 382 aa  242  7.999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  35.31 
 
 		 344 aa  239  5.999999999999999e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  44.03 
 
 		 379 aa  238  9e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  39.94 
 
 		 382 aa  238  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  37.68 
 
 		 360 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  36.6 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  38.42 
 
 		 383 aa  232  9e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  40.24 
 
 		 362 aa  232  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  38.19 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  36.1 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  40.72 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  35.68 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  36.51 
 
 		 393 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  36.77 
 
 		 393 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  35.65 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  37.31 
 
 		 387 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  37.71 
 
 		 387 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  35.91 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  35.17 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  36.9 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  33.06 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  36.28 
 
 		 361 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  37.43 
 
 		 435 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  36.46 
 
 		 436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  39.57 
 
 		 308 aa  216  5e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  39.35 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  38.42 
 
 		 464 aa  216  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  39.57 
 
 		 308 aa  216  7e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  36.99 
 
 		 394 aa  215  8e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  40.6 
 
 		 370 aa  215  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  35.38 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  36.48 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  37.42 
 
 		 357 aa  213  5.999999999999999e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  35.05 
 
 		 378 aa  212  7.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  34.47 
 
 		 386 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  34.07 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  34.82 
 
 		 406 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  31.64 
 
 		 381 aa  209  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  31.64 
 
 		 381 aa  209  9e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  37.62 
 
 		 378 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  37.11 
 
 		 451 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  37.11 
 
 		 451 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  38.21 
 
 		 347 aa  208  2e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  38 
 
 		 471 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  41.16 
 
 		 464 aa  206  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  37.68 
 
 		 474 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  36.49 
 
 		 362 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  30.75 
 
 		 379 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  33.62 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  37.14 
 
 		 359 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  29.16 
 
 		 498 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  31.08 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  32.89 
 
 		 447 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  38.04 
 
 		 456 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  33.78 
 
 		 465 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  36.32 
 
 		 477 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  30.83 
 
 		 379 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  30.83 
 
 		 379 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  30.83 
 
 		 379 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  42.36 
 
 		 397 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  33.52 
 
 		 400 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  42.36 
 
 		 397 aa  202  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  36.29 
 
 		 471 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0568  HflK protein  33.79 
 
 		 380 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0118849  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  33.42 
 
 		 460 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  30.26 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  35.09 
 
 		 442 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4168  HflK protein  33.15 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000320742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  35.09 
 
 		 454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  35.09 
 
 		 449 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  35.09 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  35.09 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  35.09 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  34.83 
 
 		 454 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  33.33 
 
 		 389 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>