More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4056 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
153 aa  310  4.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  51.3 
 
 
157 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  51.3 
 
 
157 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  49.35 
 
 
181 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  48.99 
 
 
151 aa  148  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
156 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
158 aa  147  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 
157 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  51.01 
 
 
160 aa  147  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
157 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 
161 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
159 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
156 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
153 aa  133  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
167 aa  132  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04743  transcriptional regulator  40 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 
154 aa  130  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 
158 aa  130  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  42.18 
 
 
161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 
174 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
163 aa  126  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
154 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
154 aa  124  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
160 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
156 aa  124  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.51 
 
 
159 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
155 aa  123  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
155 aa  123  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
159 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
155 aa  123  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
156 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
188 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
152 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
156 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
157 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
159 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
152 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
152 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
155 aa  121  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
154 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
159 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
152 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
152 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
152 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
177 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
159 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 
157 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
154 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 
158 aa  120  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  45.58 
 
 
152 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
154 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  44.06 
 
 
161 aa  120  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
158 aa  120  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  40 
 
 
152 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  43.33 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
164 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
153 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  38.93 
 
 
154 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  47.18 
 
 
145 aa  118  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
158 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 
155 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 
155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 
152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 
155 aa  117  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 
186 aa  117  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
174 aa  117  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  38.56 
 
 
156 aa  117  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
159 aa  117  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
158 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 
160 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  41.26 
 
 
176 aa  116  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
154 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 
160 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 
160 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 
160 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 
160 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>