More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1489 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
729 aa  1489    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00567966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3162  sensor histidine kinase  32.62 
 
 
453 aa  173  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1390  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
453 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0606319  hitchhiker  0.00201119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2525  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
449 aa  173  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1492  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
453 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.609505  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2884  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
453 aa  172  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.260369  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
453 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3013  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
453 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1149  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 
833 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355741  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 
789 aa  168  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.774871 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1337  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
453 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.154373  hitchhiker  0.00314731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
453 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1964  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
427 aa  167  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  normal  0.092514 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0214  histidine kinase  33.55 
 
 
657 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2754  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
466 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
1226 aa  165  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
1237 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2248  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
936 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.945372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  32.13 
 
 
1250 aa  161  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
1242 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2545  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.96 
 
 
454 aa  159  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  32.45 
 
 
950 aa  157  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01214  sensor histidine kinase  30.69 
 
 
450 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.699466  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1744  Signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
893 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410742  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4495  sensory box sensor histidine kinase  30.21 
 
 
508 aa  151  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2378  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
638 aa  150  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1360  cellulose binding, type IV  32.39 
 
 
544 aa  150  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1018  sensory box sensor histidine kinase  27.1 
 
 
648 aa  148  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2962  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
729 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03441  Signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
499 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2356  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
900 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0113546  normal  0.244783 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1052  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 
579 aa  140  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17007  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0081  histidine kinase  30.38 
 
 
529 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.63025  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
543 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0137414  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4374  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
690 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0438  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
914 aa  137  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.41519  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
543 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
962 aa  137  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4665  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
670 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0817  histidine kinase  32.27 
 
 
543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.874931  hitchhiker  0.000000000210514 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2082  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  28.17 
 
 
436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0339315  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3384  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
898 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3225  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
543 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000746218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
543 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.757334  hitchhiker  0.000343256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0664  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.16 
 
 
543 aa  135  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3109  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
901 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3249  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
546 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.632077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0660  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
625 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4005  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
545 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000706341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
693 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0096  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
692 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0824  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
543 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2177  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
885 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3685  histidine kinase  30.77 
 
 
708 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
893 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
900 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182555  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2516  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
805 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0736  ATPase domain-containing protein  31.62 
 
 
543 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000490957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0712  putative sensor histidine kinase  31.42 
 
 
667 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
779 aa  128  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85917  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
410 aa  127  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3894  sensor histidine kinase  31.05 
 
 
543 aa  126  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
762 aa  126  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111352  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
504 aa  127  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0299267  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4148  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
546 aa  126  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
662 aa  126  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.578499  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1706  histidine kinase  27.74 
 
 
444 aa  125  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1205  sensor histidine kinase  26.72 
 
 
580 aa  125  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1770  histidine kinase  28.11 
 
 
778 aa  125  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.54 
 
 
363 aa  124  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  28.19 
 
 
812 aa  124  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0954  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
699 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1306  histidine kinase  28.2 
 
 
663 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0116699  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1781  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  27.61 
 
 
454 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000350892  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0505  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
530 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.903517  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0547  sensor histidine kinase  31.16 
 
 
547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.562104  normal  0.0134241 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
548 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0612019  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0543  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.14 
 
 
534 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00277  Signal transduction histidine kinase (contains HAMP domain)  28.42 
 
 
560 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0867  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.79 
 
 
905 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.768776  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2390  histidine kinase  28.24 
 
 
757 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.534498  normal  0.927047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5593  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
506 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0867  ATPase domain-containing protein  26.86 
 
 
632 aa  120  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
781 aa  120  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2113  ATPase domain-containing protein  28.02 
 
 
757 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275639  normal  0.031966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3787  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
560 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
632 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0819  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.56 
 
 
393 aa  118  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
681 aa  117  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3880  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  30.66 
 
 
680 aa  117  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2270  ATPase domain-containing protein  28.08 
 
 
471 aa  117  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.250434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2545  histidine kinase  28.08 
 
 
471 aa  117  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
632 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 
675 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
527 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1486  histidine kinase  27.2 
 
 
473 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0958  histidine kinase  27.82 
 
 
632 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 
685 aa  115  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0932  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
632 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5588  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 
773 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>