More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2378 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2378  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 638 aa  1318    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0958  histidine kinase  29.2 
 
 		 632 aa  296  9e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0867  ATPase domain-containing protein  31.23 
 
 		 632 aa  293  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0932  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 632 aa  293  8e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 632 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 632 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3440  diguanylate cyclase  35.41 
 
 		 557 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0125075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3809  Signal transduction histidine kinase-like  29.3 
 
 		 612 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0214  histidine kinase  42.25 
 
 		 657 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 644 aa  211  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  37.55 
 
 		 950 aa  195  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 962 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5593  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 506 aa  193  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 1139 aa  191  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299101 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0397  diguanylate cyclase  29.75 
 
 		 555 aa  189  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 693 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3384  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 898 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1486  histidine kinase  36.76 
 
 		 473 aa  187  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1667  sensor histidine kinase  26.43 
 
 		 652 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.976342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2177  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 885 aa  187  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 1237 aa  186  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3109  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 901 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3685  histidine kinase  35.27 
 
 		 708 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2248  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 936 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.945372 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1018  sensory box sensor histidine kinase  35.41 
 
 		 648 aa  182  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2516  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 805 aa  182  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4374  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 690 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 893 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  38.15 
 
 		 1250 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 900 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182555  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1744  Signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 893 aa  179  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410742  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4665  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 670 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1306  histidine kinase  32.42 
 
 		 663 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0116699  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2270  ATPase domain-containing protein  36.02 
 
 		 471 aa  179  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.250434 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 1226 aa  179  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2356  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 900 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0113546  normal  0.244783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2545  histidine kinase  36.02 
 
 		 471 aa  178  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1360  cellulose binding, type IV  33.69 
 
 		 544 aa  177  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3778  response regulator  35.84 
 
 		 629 aa  177  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0712  putative sensor histidine kinase  32.62 
 
 		 667 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2473  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 550 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6050  putative sensor histidine kinase  35.11 
 
 		 483 aa  174  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  28.2 
 
 		 1187 aa  173  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 781 aa  173  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1071  membrane associated GGDEF protein  30.99 
 
 		 525 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0096  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 692 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03441  Signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 499 aa  172  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0081  histidine kinase  35.74 
 
 		 529 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.63025  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 789 aa  171  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774871 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 453 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00277  Signal transduction histidine kinase (contains HAMP domain)  35.34 
 
 		 560 aa  170  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01214  sensor histidine kinase  34.01 
 
 		 450 aa  170  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.699466  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1149  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 833 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355741  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1492  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 453 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.609505  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3013  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 453 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 762 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 662 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.578499  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4495  sensory box sensor histidine kinase  37.25 
 
 		 508 aa  167  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 1242 aa  168  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2754  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 466 aa  167  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2884  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 453 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.260369  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0438  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 914 aa  166  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.41519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1964  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 427 aa  165  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  normal  0.092514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2962  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 729 aa  164  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1945  putative PAS/PAC sensor protein  33.75 
 
 		 676 aa  164  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2525  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 449 aa  163  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3162  sensor histidine kinase  34.6 
 
 		 453 aa  163  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1052  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 579 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17007  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1390  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 453 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0606319  hitchhiker  0.00201119 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1337  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 453 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.154373  hitchhiker  0.00314731 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 718 aa  161  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 504 aa  161  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0299267  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 453 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2113  ATPase domain-containing protein  33.09 
 
 		 757 aa  160  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275639  normal  0.031966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2390  histidine kinase  32.48 
 
 		 757 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.534498  normal  0.927047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 410 aa  157  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 683 aa  157  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.853209  hitchhiker  0.00641465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3880  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  36.76 
 
 		 680 aa  156  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 779 aa  154  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2545  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.85 
 
 		 454 aa  154  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05442  hypothetical protein  37.07 
 
 		 539 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 729 aa  151  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00567966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1770  histidine kinase  33.07 
 
 		 778 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2082  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  35.1 
 
 		 436 aa  150  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0339315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4148  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5588  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 773 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0664  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.47 
 
 		 543 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1781  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  32.49 
 
 		 454 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000350892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0660  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 625 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3787  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 560 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4005  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 545 aa  144  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000706341 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1205  sensor histidine kinase  32.95 
 
 		 580 aa  143  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3249  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 546 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.632077 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3034  diguanylate cyclase  31.18 
 
 		 522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 575 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.899017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0954  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 699 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0505  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 530 aa  137  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.903517  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4414  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 506 aa  137  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 548 aa  134  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0612019  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1706  histidine kinase  31.03 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>