More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0660 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0660  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 625 aa  1260    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1360  cellulose binding, type IV  45.07 
 
 		 544 aa  257  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0438  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 914 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.41519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 		 662 aa  237  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.578499  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1306  histidine kinase  44.67 
 
 		 663 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0116699  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1744  Signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 		 893 aa  226  8e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410742  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2177  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 		 885 aa  226  9e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2516  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  43 
 
 		 805 aa  226  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.73 
 
 		 893 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03441  Signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 499 aa  220  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0958  histidine kinase  40.65 
 
 		 632 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2248  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 936 aa  220  7e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.945372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0214  histidine kinase  37.5 
 
 		 657 aa  220  7.999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0712  putative sensor histidine kinase  42.02 
 
 		 667 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 900 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 632 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 632 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3809  Signal transduction histidine kinase-like  45.91 
 
 		 612 aa  217  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0932  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 632 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2356  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 		 900 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0113546  normal  0.244783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0867  ATPase domain-containing protein  37.69 
 
 		 632 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3787  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 560 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 		 762 aa  213  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3109  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 901 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  36.27 
 
 		 950 aa  211  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00277  Signal transduction histidine kinase (contains HAMP domain)  35.74 
 
 		 560 aa  211  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2113  ATPase domain-containing protein  45.21 
 
 		 757 aa  211  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275639  normal  0.031966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 1226 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2390  histidine kinase  44.83 
 
 		 757 aa  209  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.534498  normal  0.927047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1770  histidine kinase  44.72 
 
 		 778 aa  206  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3384  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 898 aa  207  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1486  histidine kinase  41.67 
 
 		 473 aa  205  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0081  histidine kinase  34.26 
 
 		 529 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.63025  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 693 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4665  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 670 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 1242 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 		 779 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 962 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0096  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 692 aa  201  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4374  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 690 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5593  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3685  histidine kinase  39.53 
 
 		 708 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1052  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 579 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17007  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 789 aa  197  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774871 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 1237 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2473  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 550 aa  195  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0664  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.04 
 
 		 543 aa  195  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 410 aa  195  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2545  histidine kinase  39.58 
 
 		 471 aa  193  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2270  ATPase domain-containing protein  39.24 
 
 		 471 aa  192  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.250434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  34.67 
 
 		 1250 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 		 575 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.899017  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1018  sensory box sensor histidine kinase  37.91 
 
 		 648 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6050  putative sensor histidine kinase  37.88 
 
 		 483 aa  189  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1492  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 453 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.609505  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 453 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2884  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.260369  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3013  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3880  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  38.69 
 
 		 680 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5588  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 773 aa  183  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2754  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 466 aa  180  8e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2962  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 729 aa  180  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2525  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 449 aa  180  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 781 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3162  sensor histidine kinase  32.42 
 
 		 453 aa  178  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4495  sensory box sensor histidine kinase  34.59 
 
 		 508 aa  177  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1149  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 833 aa  176  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355741  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01214  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 450 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.699466  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1337  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 453 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.154373  hitchhiker  0.00314731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 453 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1964  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  normal  0.092514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1390  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 453 aa  174  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0606319  hitchhiker  0.00201119 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2082  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  35.02 
 
 		 436 aa  173  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0339315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 683 aa  167  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.853209  hitchhiker  0.00641465 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4414  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2378  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 638 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2545  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.59 
 
 		 454 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0954  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 699 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3225  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 543 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000746218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 543 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.757334  hitchhiker  0.000343256 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1706  histidine kinase  31.25 
 
 		 444 aa  160  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0736  ATPase domain-containing protein  31.31 
 
 		 543 aa  160  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000490957 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4005  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 545 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000706341 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1781  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  31.52 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000350892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4148  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 546 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1205  sensor histidine kinase  33 
 
 		 580 aa  157  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3894  sensor histidine kinase  30.43 
 
 		 543 aa  156  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 399 aa  151  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 504 aa  150  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0299267  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 644 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 543 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3249  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 546 aa  147  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.632077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0505  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 530 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.903517  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 729 aa  146  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00567966 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 548 aa  146  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0612019  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0817  histidine kinase  29.41 
 
 		 543 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.874931  hitchhiker  0.000000000210514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 543 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0137414  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0824  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 919 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0658  sensor histide kinase  33.44 
 
 		 315 aa  138  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>