More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1466 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1466  response regulator receiver protein  100 
 
 		 261 aa  526  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000484673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 		 1202 aa  109  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 724 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.02 
 
 		 1468 aa  105  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  29.8 
 
 		 1014 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 1193 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  33.74 
 
 		 727 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  30.48 
 
 		 968 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1923  response regulator receiver domain-containing protein  29.03 
 
 		 569 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.285353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.34 
 
 		 932 aa  99.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 		 718 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.4 
 
 		 1499 aa  97.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 		 990 aa  97.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 784 aa  96.3  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  29.44 
 
 		 1021 aa  95.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 		 818 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 		 817 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  35.16 
 
 		 1351 aa  93.6  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  29 
 
 		 1653 aa  93.2  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 		 843 aa  93.2  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 864 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  30.3 
 
 		 1560 aa  92.4  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.04 
 
 		 1442 aa  92  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 1090 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 738 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 957 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 		 818 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 		 695 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 1042 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 		 850 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  36.23 
 
 		 661 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 		 785 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  28.99 
 
 		 1417 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  42.28 
 
 		 676 aa  89.4  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  30.47 
 
 		 1418 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0206  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 		 771 aa  89  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  41.96 
 
 		 582 aa  89  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.58 
 
 		 932 aa  88.6  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  25.74 
 
 		 1574 aa  88.6  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  38.98 
 
 		 785 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 		 1005 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  38.98 
 
 		 785 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 899 aa  88.6  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.618287  normal  0.57938 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 		 1480 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 		 929 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4614  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 923 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863482  normal  0.296425 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 833 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0611  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 925 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 		 879 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  41.6 
 
 		 1028 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  44.04 
 
 		 641 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  42.98 
 
 		 588 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1229 aa  85.9  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4868  sensor histidine kinase/response regulator RetS  38.46 
 
 		 929 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  44.04 
 
 		 645 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0244  two component system histidine kinase  38.94 
 
 		 657 aa  85.9  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.43 
 
 		 789 aa  86.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 1057 aa  85.9  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  30.89 
 
 		 932 aa  85.9  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  38.98 
 
 		 785 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1954  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  38.94 
 
 		 657 aa  85.9  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1546  histidine kinase  37.93 
 
 		 545 aa  85.5  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  40.91 
 
 		 925 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 572 aa  85.5  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  40.91 
 
 		 925 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 		 781 aa  85.5  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 		 985 aa  85.1  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  31.84 
 
 		 942 aa  85.1  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.07 
 
 		 950 aa  85.5  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 764 aa  85.5  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.24 
 
 		 933 aa  85.1  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 		 993 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 835 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 		 921 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.39 
 
 		 1331 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 916 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.59 
 
 		 2213 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0290  histidine kinase  37.5 
 
 		 931 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.52 
 
 		 922 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  29.2 
 
 		 1439 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1240 aa  84  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  40.34 
 
 		 779 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4877  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 923 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.876139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  38.98 
 
 		 785 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 916 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1560 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 880 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  42.11 
 
 		 578 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  25.78 
 
 		 937 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  34.81 
 
 		 1322 aa  84  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.51 
 
 		 937 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  30.81 
 
 		 1206 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4408  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:histidine kinase:histidine kinase  38.94 
 
 		 929 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 1374 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.17 
 
 		 777 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 		 1258 aa  83.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 1260 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  39.68 
 
 		 651 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  31.31 
 
 		 982 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 		 1199 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>