69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0971 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0971  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
591 aa  1181  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  31.55 
 
 
1290 aa  72.8  2e-11  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.05 
 
 
1424 aa  70.1  1e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
568 aa  68.9  2e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.75 
 
 
568 aa  68.9  2e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 
454 aa  68.6  3e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
444 aa  68.9  3e-10  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 
1186 aa  66.6  1e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
284 aa  66.2  1e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 
924 aa  66.6  1e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  32 
 
 
672 aa  66.2  2e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 
949 aa  65.9  2e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.53 
 
 
991 aa  65.9  2e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.54 
 
 
771 aa  65.1  3e-09  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 
1105 aa  65.1  4e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.82587e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 
751 aa  63.2  1e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  25.34 
 
 
919 aa  63.5  1e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
190 aa  63.5  1e-08  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 
911 aa  62.8  2e-08  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.89 
 
 
2145 aa  62.8  2e-08  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 
1288 aa  62.4  2e-08  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.78 
 
 
885 aa  61.6  4e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 
767 aa  61.2  5e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  23.64 
 
 
822 aa  60.8  6e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  30.38 
 
 
1056 aa  60.8  7e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.47 
 
 
787 aa  60.5  1e-07  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5384  serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 
1109 aa  59.7  1e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00425552  normal  0.786393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  30.57 
 
 
1039 aa  59.3  2e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  27.87 
 
 
1131 aa  59.7  2e-07  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
814 aa  57.8  6e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  28.12 
 
 
362 aa  57.4  8e-07  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 
785 aa  57.4  8e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 
1088 aa  57  1e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  26.51 
 
 
1550 aa  56.2  2e-06  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44116  predicted protein  23.12 
 
 
757 aa  55.1  4e-06  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
966 aa  54.7  5e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 
1215 aa  53.9  8e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  28.57 
 
 
825 aa  53.9  8e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  23.42 
 
 
493 aa  53.1  1e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  25.93 
 
 
1040 aa  52.4  2e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  26.39 
 
 
1404 aa  52.4  2e-05  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49102  predicted protein  26.76 
 
 
1731 aa  52.4  2e-05  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  22.98 
 
 
1050 aa  52.8  2e-05  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  30.3 
 
 
732 aa  52.4  3e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  25.37 
 
 
1106 aa  51.6  4e-05  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 
843 aa  51.6  4e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 
443 aa  51.6  4e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
837 aa  50.8  6e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  29.32 
 
 
1328 aa  51.2  6e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
953 aa  50.8  7e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
481 aa  50.4  9e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  28.76 
 
 
212 aa  50.4  9e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  22.5 
 
 
828 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  25.13 
 
 
694 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  25.35 
 
 
1212 aa  49.3  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  27.37 
 
 
1507 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  28.11 
 
 
919 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  22.91 
 
 
1415 aa  47.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  21.86 
 
 
2327 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04908  eukaryotic translation initiation factor 3 subunit CLU1/TIF31, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10800)  24.4 
 
 
1130 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5601  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
900 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  27.74 
 
 
963 aa  46.2  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  24.52 
 
 
311 aa  46.2  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1157  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.78 
 
 
1007 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  36 
 
 
1028 aa  44.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 
854 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80259  accessory factor to EIF3  26.53 
 
 
1242 aa  44.3  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0940196 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_10581  predicted protein  30.48 
 
 
115 aa  43.9  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.342186 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  48.08 
 
 
640 aa  44.3  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>