48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_80259 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_80259  accessory factor to EIF3  100 
 
 		 1242 aa  2538    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0940196 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02490  translational initiation-related protein, putative  26.02 
 
 		 1502 aa  347  1e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04908  eukaryotic translation initiation factor 3 subunit CLU1/TIF31, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10800)  31.63 
 
 		 1130 aa  339  1.9999999999999998e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43732  predicted protein  28.66 
 
 		 1504 aa  145  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.576008  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  24.7 
 
 		 825 aa  73.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.65 
 
 		 771 aa  64.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.04 
 
 		 1424 aa  64.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 751 aa  63.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  26.6 
 
 		 1468 aa  62.4  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 949 aa  61.6  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 454 aa  61.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.51 
 
 		 1186 aa  58.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1105 aa  58.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 924 aa  58.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.11 
 
 		 1288 aa  57.4  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  24.44 
 
 		 801 aa  57.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  23.04 
 
 		 1228 aa  56.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49102  predicted protein  21.2 
 
 		 1731 aa  54.3  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  22.62 
 
 		 1056 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 814 aa  53.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 		 284 aa  53.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  23 
 
 		 493 aa  52  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  22.39 
 
 		 828 aa  51.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 481 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.67 
 
 		 787 aa  51.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1028 aa  51.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 953 aa  50.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  24.79 
 
 		 362 aa  49.3  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.12 
 
 		 841 aa  48.5  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.19 
 
 		 885 aa  48.5  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 469 aa  48.5  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 991 aa  48.5  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 1283 aa  48.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0229  TIR protein  21.86 
 
 		 965 aa  48.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105613  normal  0.178125 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  20.62 
 
 		 919 aa  47.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  32.76 
 
 		 212 aa  47.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  25.93 
 
 		 686 aa  47.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 843 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 190 aa  46.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47294  predicted protein  26.05 
 
 		 777 aa  46.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599773  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  21.5 
 
 		 1131 aa  46.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  21.37 
 
 		 694 aa  46.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1039 aa  46.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5159  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 279 aa  46.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.738281  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  22.97 
 
 		 963 aa  46.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  22.22 
 
 		 732 aa  45.8  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  24.88 
 
 		 311 aa  45.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  22.99 
 
 		 1488 aa  45.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>