144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2890 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  100 
 
 
289 aa  598  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  69.1 
 
 
289 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  64.01 
 
 
289 aa  379  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  60.9 
 
 
290 aa  362  4e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  64.46 
 
 
289 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  38.89 
 
 
303 aa  189  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  36.96 
 
 
321 aa  175  8e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  40.13 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  34.17 
 
 
322 aa  146  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  33.22 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  32.73 
 
 
327 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  36.7 
 
 
336 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  33.67 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  33.81 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  36.3 
 
 
330 aa  119  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  31.93 
 
 
356 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  32.62 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  34.71 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  34.55 
 
 
328 aa  112  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  30.46 
 
 
313 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  32.23 
 
 
314 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  31.01 
 
 
310 aa  102  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  30.56 
 
 
306 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  31.92 
 
 
276 aa  99  9e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  31.47 
 
 
316 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  29.89 
 
 
310 aa  92.8  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  32.87 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  28.21 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  28.21 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  27.05 
 
 
317 aa  86.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  29.97 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  27.11 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  32.28 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  27.82 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  26.67 
 
 
432 aa  82.4  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  29 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  31.42 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  30.6 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  26.09 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  32.24 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  31.09 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  25.4 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  29.15 
 
 
735 aa  75.5  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  34.86 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  30.94 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  26.73 
 
 
375 aa  72.8  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  31.56 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  27.97 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  24.72 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  29.15 
 
 
900 aa  70.1  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  30.43 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  30.43 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  26.67 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  28.8 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  23.86 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  26.62 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  25.56 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  28.8 
 
 
350 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  24.79 
 
 
351 aa  63.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  26.88 
 
 
369 aa  62.4  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  26.72 
 
 
349 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  26.7 
 
 
349 aa  60.8  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0782  GHMP kinase  25.66 
 
 
323 aa  58.9  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  24.69 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  30.09 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1575  phosphomevalonate kinase  26.78 
 
 
322 aa  57  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00534382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  27.48 
 
 
370 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  22.51 
 
 
297 aa  56.6  0.0000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  21.87 
 
 
380 aa  56.2  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  26.14 
 
 
414 aa  55.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  28.97 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1102  phosphomevalonate kinase  25.49 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.029164  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  25.85 
 
 
405 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  27.16 
 
 
388 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  26.11 
 
 
373 aa  53.1  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  22.77 
 
 
389 aa  52.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  25.55 
 
 
372 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  21.6 
 
 
383 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  36.55 
 
 
347 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  21.6 
 
 
383 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  21.6 
 
 
383 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  24.54 
 
 
356 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  21.95 
 
 
384 aa  50.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  24.49 
 
 
383 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  25 
 
 
389 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  23.92 
 
 
394 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  24.58 
 
 
392 aa  49.7  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  23.4 
 
 
403 aa  49.3  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  25.99 
 
 
357 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  26.36 
 
 
354 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  23.24 
 
 
395 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  25.31 
 
 
393 aa  48.9  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  25.7 
 
 
339 aa  48.9  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  25.52 
 
 
387 aa  48.9  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  23.05 
 
 
385 aa  48.5  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0240  phosphomevalonate kinase  24.68 
 
 
358 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0615  phosphomevalonate kinase  23.65 
 
 
358 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  24.59 
 
 
391 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0630  phosphomevalonate kinase  23.65 
 
 
358 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  26.86 
 
 
490 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>