More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1512 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1512  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 286 aa  585  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  51.16 
 
 		 299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3554  Lytic transglycosylase catalytic  42.12 
 
 		 343 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  41.76 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  40.64 
 
 		 380 aa  192  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  42.11 
 
 		 341 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  39.67 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  39.56 
 
 		 330 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4762  hypothetical protein  41.64 
 
 		 359 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1642  Lytic transglycosylase catalytic  39.93 
 
 		 318 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1459  Lytic transglycosylase catalytic  41.96 
 
 		 318 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  41.26 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  38.79 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  39.41 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  39.16 
 
 		 328 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1242  lytic transglycosylase catalytic  43.3 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270703  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  39.02 
 
 		 328 aa  178  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0809  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  40.15 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1463  transglycosylase  59.6 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  36.77 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  52.9 
 
 		 363 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  52.9 
 
 		 363 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  47.33 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  52.76 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  50.35 
 
 		 340 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  52.71 
 
 		 246 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  51.54 
 
 		 239 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  51.54 
 
 		 278 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0029  Lytic transglycosylase catalytic  53.28 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240678  normal  0.132165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1277  Lytic transglycosylase catalytic  51.52 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  47.86 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  45.69 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  42.02 
 
 		 202 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  46.09 
 
 		 438 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  44.17 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 228 aa  89.7  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  42.34 
 
 		 217 aa  89  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  38.81 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 235 aa  87  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  42.61 
 
 		 283 aa  86.7  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  39.23 
 
 		 242 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 244 aa  85.9  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  43.97 
 
 		 218 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  43.36 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  39.06 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  42.02 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  37.78 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  46.61 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  41.88 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  43.22 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  45.05 
 
 		 368 aa  82.4  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  38.4 
 
 		 207 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  39.39 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 		 199 aa  82  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  43.24 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  41.48 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  40.87 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  39.17 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  36.77 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  39.32 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  39.09 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  37.66 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  36.11 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  38.18 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  32.88 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  35.26 
 
 		 1160 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  36.89 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  39.32 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5361  lytic transglycosylase, catalytic  40.68 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.716209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  45.05 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  41.73 
 
 		 158 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  38.33 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  36.88 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  36.84 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  41.88 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  46.36 
 
 		 202 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  40.87 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  40.52 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  39.32 
 
 		 174 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  36.92 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  40.17 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  40.15 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  39.47 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  37.98 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  40.18 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  40.15 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  38.46 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  44.55 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4565  lytic transglycosylase catalytic  34.81 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0155983  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4180  lytic transglycosylase, catalytic  40.62 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>