More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3604 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  80.19 
 
 		 208 aa  337  5.9999999999999996e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  73.58 
 
 		 251 aa  317  7.999999999999999e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  79.76 
 
 		 168 aa  274  6e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  48.84 
 
 		 217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  48.57 
 
 		 219 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  48.1 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  46.92 
 
 		 219 aa  191  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0418  cobalamin-dependent methionine synthase, B12-binding  51.72 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  51.83 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  55.49 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2784  cobalamin B12-binding protein  46.31 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0108719  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  48.31 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  43.93 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19540  predicted cobalamin binding protein  48.85 
 
 		 219 aa  174  9e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  hitchhiker  0.00000629767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  46.19 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  42.99 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  45.41 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  46.77 
 
 		 804 aa  164  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  42.93 
 
 		 841 aa  161  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  47.16 
 
 		 224 aa  160  9e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  43.4 
 
 		 813 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  45.32 
 
 		 800 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  43.4 
 
 		 811 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  45.27 
 
 		 806 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  43.41 
 
 		 839 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  43.41 
 
 		 804 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  43.75 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  42.78 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  44.02 
 
 		 801 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  46.29 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  46.29 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  42.31 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  48.78 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  41.12 
 
 		 804 aa  151  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1827  cobalamin B12-binding domain protein  39.81 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  46.37 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  39.07 
 
 		 259 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  42.93 
 
 		 804 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  45.81 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  40.61 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  40.09 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  42.36 
 
 		 802 aa  147  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1110  cobalamin B12-binding domain-containing protein  43.23 
 
 		 208 aa  147  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3199  Methionine synthase B12-binding module cap domain protein  41.87 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  39.71 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  39.71 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  44.63 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0597  cobalamin B12-binding domain-containing protein  43.68 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  44.94 
 
 		 804 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  39.81 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  44.71 
 
 		 326 aa  145  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  42.16 
 
 		 818 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  39.71 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  39.52 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1107  cobalamin B12-binding domain protein  44.31 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4611  cobalamin B12-binding domain protein  43.35 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.855843  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15360  Methionine synthase  42.11 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  43.82 
 
 		 804 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  37.74 
 
 		 819 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  41.67 
 
 		 768 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4641  cobalamin B12-binding domain protein  43.27 
 
 		 213 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  40.78 
 
 		 807 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  41.53 
 
 		 780 aa  137  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  40.91 
 
 		 820 aa  137  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  39.22 
 
 		 607 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  39.89 
 
 		 801 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0720  cobalamin B12-binding domain protein  39.41 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1895  cobalamin B12-binding domain protein  43.11 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  41.15 
 
 		 768 aa  135  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3634  monomethylamine corrinoid protein  42.68 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4321  cobalamin B12-binding domain protein  38.35 
 
 		 214 aa  134  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0842  monomethylamine corrinoid protein  42.68 
 
 		 217 aa  134  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2567  cobalamin B12-binding domain protein  41.34 
 
 		 206 aa  134  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474708  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  39.49 
 
 		 791 aa  134  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0845  monomethylamine corrinoid protein  38.89 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1835  cobalamin B12-binding domain protein  36.63 
 
 		 212 aa  131  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  35.68 
 
 		 793 aa  131  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  37.86 
 
 		 841 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  39.33 
 
 		 781 aa  129  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1603  cobalamin B12-binding domain protein  38.18 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000910131  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3658  cobalamin B12-binding domain-containing protein  37.99 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  39.89 
 
 		 816 aa  125  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  40.51 
 
 		 556 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2964  cobalamin B12-binding domain-containing protein  36.97 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0486605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0387  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  36.1 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.682962  normal  0.201782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1316  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  36.1 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.518339 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1206  cobalamin B12-binding  33.17 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  36.32 
 
 		 774 aa  121  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3886  cobalamin B12-binding domain protein  37.5 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000310147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  38.5 
 
 		 803 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0740  methanol corrinoid protein  35 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0539  cobalamin B12-binding domain protein  34.65 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4255  B12-dependent methionine synthase  41.08 
 
 		 1227 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0705471  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3978  methionine synthase  41.08 
 
 		 1227 aa  118  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5489  B12-dependent methionine synthase  41.08 
 
 		 1227 aa  118  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4011  B12-dependent methionine synthase  41.08 
 
 		 1227 aa  118  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.960796  normal  0.0169283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2368  cobalamin B12-binding domain protein  38.32 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4563  B12-dependent methionine synthase  41.08 
 
 		 1227 aa  118  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03851  hypothetical protein  41.08 
 
 		 1227 aa  118  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>