More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0011 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0011  DNA polymerase III, delta prime subunit  100 
 
 		 247 aa  476  1e-133  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.158279  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl675  DNA polymerase III delta' subunit  40.56 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  37.11 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  29.1 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  37.11 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  36.08 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  37.11 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.38 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  35.07 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0019  DNA polymerase III delta subunit  32.09 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  36.46 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  33.93 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5416  DNA polymerase III, delta prime subunit  28 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0548  DNA-directed DNA polymerase  37.62 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.713623  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0518  DNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0375901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.12 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  30.83 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000856784 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0505  DNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0387  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.71 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210264  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.36 
 
 		 737 aa  62.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0122  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  33.61 
 
 		 308 aa  62  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0715  DNA-directed DNA polymerase  32.03 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0374  DNA replication ATPase  36.94 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.885704  hitchhiker  0.00000094265 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl678  DNA polymerase III gamma and tau subunits  44.19 
 
 		 631 aa  60.1  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4543  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.84 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  30.53 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  30.95 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2782  DNA polymerase III subunit delta'  28.57 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1778  DNA polymerase III, delta subunit, putative  33.64 
 
 		 391 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  32.5 
 
 		 360 aa  58.5  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  32.5 
 
 		 360 aa  58.5  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0587  DNA-directed DNA polymerase  32.03 
 
 		 388 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  32.98 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  32 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.94 
 
 		 329 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.85 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1574  DNA polymerase III subunit delta'  32.52 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  31.91 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  39.36 
 
 		 548 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1582  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5507  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.35 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.30319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3112  DNA replication ATPase  23.53 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.347103  normal  0.240633 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  32.48 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1629  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.2 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000209012  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03320  putative DNA polymerase III, delta subunit  31.68 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0355  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.6 
 
 		 381 aa  55.8  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  23.2 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0843  DNA polymerase III subunit delta'  32.29 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  36.43 
 
 		 669 aa  55.8  0.0000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1602  DNA-directed DNA polymerase  38.1 
 
 		 388 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.772153 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.17 
 
 		 520 aa  55.5  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  29.66 
 
 		 321 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.86 
 
 		 589 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.23 
 
 		 460 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0830  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.17 
 
 		 580 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0527  DNA polymerase III subunit delta'  33.61 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0611  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.5 
 
 		 465 aa  54.3  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8400  DNA polymerase III subunit delta'  30.77 
 
 		 395 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3466  DNA polymerase III subunit delta'  29.59 
 
 		 394 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  26.09 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9220  DNA-directed DNA polymerase  27.55 
 
 		 393 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.74 
 
 		 320 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.88 
 
 		 320 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.34 
 
 		 427 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  35.35 
 
 		 321 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1276  DNA polymerase III subunit delta'  39.74 
 
 		 374 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.18 
 
 		 334 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.01 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0578  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.21 
 
 		 431 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  23.66 
 
 		 322 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.62 
 
 		 327 aa  53.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0411  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  41.03 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0662  AAA ATPase  24.24 
 
 		 385 aa  52.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.300478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  37.11 
 
 		 600 aa  52.8  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32580  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  27.66 
 
 		 378 aa  52.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1405  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.62 
 
 		 300 aa  52.8  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.989763  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0610  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.42 
 
 		 386 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0430331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 326 aa  52.4  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2647  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 304 aa  52.4  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.11798 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  38.46 
 
 		 312 aa  52.4  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  28.57 
 
 		 358 aa  52.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0281  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.27 
 
 		 300 aa  52.4  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.43 
 
 		 342 aa  52  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.91 
 
 		 351 aa  52  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1870  DNA-directed DNA polymerase  28.57 
 
 		 390 aa  52  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.3 
 
 		 358 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  28.26 
 
 		 361 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  23.2 
 
 		 373 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1535  putative DNA polymerase III delta prime subunit  33.87 
 
 		 372 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  37.93 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1486  DNA polymerase III subunit delta'  41.43 
 
 		 352 aa  51.6  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.585523  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.63 
 
 		 330 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  40 
 
 		 354 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0379488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>