235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1404 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  100 
 
 		 578 aa  1203    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08967  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14300)  29.28 
 
 		 497 aa  176  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.557658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08380  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.19 
 
 		 479 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3340  FAD linked oxidase domain protein  25.86 
 
 		 481 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2161  hypothetical protein  25.74 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0825  FAD linked oxidase-like  25.69 
 
 		 451 aa  124  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.87 
 
 		 456 aa  124  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  26.32 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7151  FAD linked oxidase-like protein  24.13 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591549  normal  0.0143598 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1284  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.02 
 
 		 463 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5275  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.08 
 
 		 459 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4907  FAD linked oxidase-like protein  23.33 
 
 		 459 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4996  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.33 
 
 		 459 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5531  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.55 
 
 		 463 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  22.94 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13751  hypothetical protein  22.91 
 
 		 466 aa  110  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.445765 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1916  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.44 
 
 		 459 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0355003  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5005  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.23 
 
 		 447 aa  107  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.205083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1076  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.4 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0950999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4013  FAD linked oxidase domain protein  23.65 
 
 		 481 aa  99  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0966  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.66 
 
 		 460 aa  95.5  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  29.56 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.07 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3803  FAD linked oxidase domain protein  23 
 
 		 493 aa  73.9  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.935771  normal  0.2974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.14 
 
 		 462 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  32.17 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  32.03 
 
 		 441 aa  66.6  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.14 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  27.03 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  27.03 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  31.78 
 
 		 378 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.15 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.15 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  28.95 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.88 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  31.45 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  30.17 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  28.93 
 
 		 438 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  29.37 
 
 		 437 aa  60.1  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  31.9 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  29.01 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  26.04 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  31.25 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  29.33 
 
 		 584 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.48 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  32.54 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  33.66 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  28.39 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 		 491 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.43 
 
 		 433 aa  56.6  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  26.23 
 
 		 472 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.39 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  27.2 
 
 		 475 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30 
 
 		 474 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.21 
 
 		 490 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.9 
 
 		 433 aa  56.6  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.7 
 
 		 429 aa  55.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  29.73 
 
 		 437 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  28.1 
 
 		 479 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.08 
 
 		 464 aa  55.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.03 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  28.91 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  30.17 
 
 		 438 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  31.09 
 
 		 479 aa  54.3  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  28.32 
 
 		 442 aa  54.3  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  26.15 
 
 		 478 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 		 440 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  28.83 
 
 		 425 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  29.59 
 
 		 459 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  28.46 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  27.15 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 470 aa  52.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  25.69 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  23.57 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  29.82 
 
 		 481 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  30.08 
 
 		 461 aa  52  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  25 
 
 		 444 aa  52  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.46 
 
 		 474 aa  52.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  32.97 
 
 		 465 aa  52.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  24.42 
 
 		 432 aa  51.6  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.03 
 
 		 437 aa  51.6  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  26.83 
 
 		 474 aa  51.6  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  28.05 
 
 		 452 aa  51.6  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  28.68 
 
 		 457 aa  51.6  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  27.35 
 
 		 471 aa  51.2  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  27.12 
 
 		 478 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  26.53 
 
 		 442 aa  51.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.64 
 
 		 474 aa  51.2  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  25.69 
 
 		 478 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  25.44 
 
 		 437 aa  51.2  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 474 aa  51.2  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  25.81 
 
 		 596 aa  50.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  27.35 
 
 		 478 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  27.35 
 
 		 478 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  25.94 
 
 		 465 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  26.56 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  28.91 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.33 
 
 		 726 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  25.71 
 
 		 462 aa  50.4  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>