More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03205 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  100 
 
 		 542 aa  1105    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 653 aa  336  5e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 		 662 aa  332  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 437 aa  276  7e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 399 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1951  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.86 
 
 		 603 aa  244  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 401 aa  242  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  34.88 
 
 		 400 aa  233  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1377  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 731 aa  220  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 932 aa  220  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 		 579 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  61.11 
 
 		 321 aa  217  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 969 aa  217  5e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  33.42 
 
 		 398 aa  210  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 		 1452 aa  208  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08061  hypothetical protein  33.82 
 
 		 406 aa  207  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 		 1015 aa  207  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 		 1322 aa  207  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  33.92 
 
 		 746 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 737 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 844 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 844 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 1350 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 		 877 aa  204  5e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02676  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 		 847 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.86 
 
 		 1550 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.17 
 
 		 1433 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3325  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 667 aa  200  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2378  PAS  33 
 
 		 901 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.756345  normal  0.766649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.26 
 
 		 939 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0229  histidine kinase  36.08 
 
 		 724 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0610831  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 1596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  33 
 
 		 539 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 		 860 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 		 1410 aa  197  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1059 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 1182 aa  197  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  32.32 
 
 		 732 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2551  ATP-binding region ATPase domain protein  31.55 
 
 		 398 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 878 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 1146 aa  196  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  31.93 
 
 		 779 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3747  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.9 
 
 		 781 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.244728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  33.74 
 
 		 620 aa  194  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 973 aa  194  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  35 
 
 		 900 aa  194  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  33.87 
 
 		 736 aa  194  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 984 aa  194  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  32.82 
 
 		 735 aa  193  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.48 
 
 		 442 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  52.35 
 
 		 343 aa  193  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 1127 aa  193  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 920 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 859 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  33.68 
 
 		 968 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3195  sensor histidine kinase  31.78 
 
 		 438 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211172  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 1066 aa  192  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 869 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 1009 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 		 1143 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  32.98 
 
 		 603 aa  191  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1078 aa  191  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1601  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 		 685 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0518398  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 		 1125 aa  190  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.62 
 
 		 738 aa  190  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 		 1199 aa  190  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 		 639 aa  190  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.97 
 
 		 640 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 1099 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 		 1049 aa  189  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 863 aa  189  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  31.54 
 
 		 1161 aa  189  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  33.56 
 
 		 1560 aa  189  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 1406 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  33.5 
 
 		 666 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1753  sensor protein LuxQ  31.77 
 
 		 583 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042622 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1012  response regulator, histidine kinase  32.36 
 
 		 578 aa  189  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  33.5 
 
 		 729 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 896 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  32.72 
 
 		 697 aa  188  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2833  histidine kinase  32.63 
 
 		 576 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1055  sensor histidine kinase/response regulator  34.29 
 
 		 514 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 		 606 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 762 aa  189  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  32.14 
 
 		 1028 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  56.86 
 
 		 506 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01633  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.47 
 
 		 784 aa  187  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 		 1178 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 657 aa  187  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003464  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 573 aa  187  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08056  hypothetical protein  31.49 
 
 		 407 aa  187  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 		 1340 aa  187  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 801 aa  187  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 		 945 aa  187  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1271 aa  187  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0876  response regulator receiver  32.77 
 
 		 526 aa  186  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183507 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3381  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 902 aa  187  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.247292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 1157 aa  187  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 		 1350 aa  186  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 817 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>