206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1072 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  100 
 
 		 423 aa  839    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  47.68 
 
 		 425 aa  364  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  43.52 
 
 		 429 aa  315  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  34.03 
 
 		 441 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  31.17 
 
 		 816 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  26.41 
 
 		 415 aa  113  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  27.45 
 
 		 417 aa  113  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  26.15 
 
 		 415 aa  112  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  25.13 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  26.24 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  26.26 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  28.2 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  27.86 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  26.75 
 
 		 442 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  27.23 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  24.94 
 
 		 437 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  27.87 
 
 		 435 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 436 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  25.54 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  34 
 
 		 184 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  28.61 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  26.07 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  25.8 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  34.29 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  34.71 
 
 		 175 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  35.2 
 
 		 208 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  28.97 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  26.27 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6863  polysaccharide export protein  28.68 
 
 		 529 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  28.24 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.94 
 
 		 152 aa  72.4  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  32.23 
 
 		 221 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  24.81 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  28.26 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  29.69 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  24.15 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  25.2 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  27.91 
 
 		 178 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  25.2 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3022  polysaccharide export protein  25.25 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  33.61 
 
 		 219 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6739  polysaccharide export protein  37.14 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  35.25 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  25.6 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  35 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  35.77 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  32.26 
 
 		 195 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  33.06 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  30.58 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  33.06 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  31.4 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  31.4 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  33.06 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  33.06 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  29.75 
 
 		 191 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  30.33 
 
 		 195 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  28 
 
 		 185 aa  62.4  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  29.33 
 
 		 185 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  31.25 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  30.33 
 
 		 196 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  33.06 
 
 		 190 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 177 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  29.75 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  28.93 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  34.09 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  32.84 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  38.54 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  28.1 
 
 		 177 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  28.1 
 
 		 177 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.05 
 
 		 193 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  28.93 
 
 		 189 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  35.25 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  31.97 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  30.58 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  28.93 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  31.4 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  30.58 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  33.58 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2488  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  37.04 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  27.13 
 
 		 910 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  31.73 
 
 		 192 aa  55.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  25 
 
 		 186 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  28.69 
 
 		 508 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 253 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  29.92 
 
 		 948 aa  53.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 237 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  28.12 
 
 		 201 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  30.82 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  27.82 
 
 		 185 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  32.37 
 
 		 202 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  26.36 
 
 		 920 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  26.4 
 
 		 212 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  26.77 
 
 		 919 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  33.06 
 
 		 196 aa  53.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  27.82 
 
 		 185 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  27.82 
 
 		 185 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  26.36 
 
 		 837 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  26.36 
 
 		 837 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>