98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2133 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  100 
 
 		 626 aa  608  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2133  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992239  normal  0.0302754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  60 
 
 		 630 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  45.55 
 
 		 625 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  45.98 
 
 		 595 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  43.59 
 
 		 611 aa  242  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  41.32 
 
 		 616 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  45.45 
 
 		 640 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  43.77 
 
 		 618 aa  228  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  43.77 
 
 		 618 aa  228  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  45.06 
 
 		 632 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  44.66 
 
 		 640 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  43.87 
 
 		 640 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  43.87 
 
 		 640 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  39.79 
 
 		 636 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  40.56 
 
 		 556 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  40.56 
 
 		 556 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  40.56 
 
 		 556 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  40.56 
 
 		 556 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  39.75 
 
 		 562 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  39.75 
 
 		 572 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  39.75 
 
 		 509 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  38.02 
 
 		 560 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  35.71 
 
 		 554 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  37.9 
 
 		 548 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  35.74 
 
 		 547 aa  169  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  35.74 
 
 		 551 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  36.94 
 
 		 547 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  32.53 
 
 		 542 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  34.29 
 
 		 536 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  30.94 
 
 		 618 aa  132  9e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  33.77 
 
 		 541 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  33.77 
 
 		 541 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  33.77 
 
 		 541 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  33.77 
 
 		 541 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  36.04 
 
 		 552 aa  126  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  29.8 
 
 		 614 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  33.19 
 
 		 599 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  33.19 
 
 		 599 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  41.84 
 
 		 422 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  30.9 
 
 		 497 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  27.06 
 
 		 560 aa  87  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  27.73 
 
 		 550 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  30.37 
 
 		 810 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  25 
 
 		 677 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  25 
 
 		 652 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  25 
 
 		 652 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 652 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  25.5 
 
 		 636 aa  73.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  24.64 
 
 		 670 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  26.27 
 
 		 774 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  40.22 
 
 		 626 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  27.75 
 
 		 649 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  25.55 
 
 		 617 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  25.55 
 
 		 617 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  26.61 
 
 		 704 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4687  integrase, catalytic region  28.97 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.887528  normal  0.0224693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  25.94 
 
 		 733 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  25.75 
 
 		 558 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  25.75 
 
 		 558 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3210  integrase catalytic subunit  25.91 
 
 		 782 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  27.47 
 
 		 721 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  33.07 
 
 		 710 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  24.53 
 
 		 561 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  25.97 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  26.3 
 
 		 614 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  26.3 
 
 		 614 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  26.3 
 
 		 614 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  24.03 
 
 		 663 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  25.43 
 
 		 653 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  24.55 
 
 		 497 aa  53.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  24.55 
 
 		 497 aa  53.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  24.55 
 
 		 497 aa  53.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2088  hypothetical protein  22.48 
 
 		 749 aa  52.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  26.38 
 
 		 481 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0882  hypothetical protein  23.92 
 
 		 628 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  23.38 
 
 		 715 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0496  integrase  24.53 
 
 		 523 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.772953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  23.38 
 
 		 715 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  25.98 
 
 		 481 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  26.4 
 
 		 902 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  23.31 
 
 		 555 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 		 905 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 		 905 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 		 905 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 		 905 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 		 905 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  26.4 
 
 		 917 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  23.21 
 
 		 754 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  30.08 
 
 		 644 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1192  integrase, catalytic region  23.67 
 
 		 740 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06219  hypothetical protein  20.82 
 
 		 333 aa  46.6  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  23.53 
 
 		 575 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0016  hypothetical protein  22.18 
 
 		 662 aa  45.8  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 		 662 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 		 662 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7026  Tn7-like transposition protein B  23.56 
 
 		 735 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.314697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>