More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4100 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
1377 aa  2712  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.25277e-08 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
1048 aa  499  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  32.05 
 
 
1105 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  33.24 
 
 
1122 aa  450  1e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.11 
 
 
1149 aa  389  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.39 
 
 
1151 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  30.64 
 
 
1139 aa  376  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  29.91 
 
 
1148 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  30.49 
 
 
1151 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  30.98 
 
 
1037 aa  364  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  30.45 
 
 
1138 aa  362  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  33.85 
 
 
1065 aa  357  7e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  30.47 
 
 
1046 aa  351  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.35 
 
 
1141 aa  348  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  31.87 
 
 
1043 aa  338  4e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  29.15 
 
 
1055 aa  311  7e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.83 
 
 
1175 aa  307  8e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.97 
 
 
1117 aa  298  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  28.26 
 
 
1403 aa  283  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  29.36 
 
 
1402 aa  275  5e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 
1398 aa  262  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  30.22 
 
 
1227 aa  260  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.32 
 
 
1023 aa  243  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  27.4 
 
 
1134 aa  227  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 
1311 aa  219  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  26.95 
 
 
1133 aa  220  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  27.51 
 
 
1358 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  30.55 
 
 
1027 aa  218  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  30.27 
 
 
1027 aa  214  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  30.27 
 
 
1027 aa  214  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  27.12 
 
 
1342 aa  212  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 
1349 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 
1349 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  26.37 
 
 
1349 aa  206  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 
1348 aa  203  1e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.15 
 
 
1291 aa  197  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.04 
 
 
1087 aa  193  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  28.21 
 
 
1353 aa  192  3e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  25.49 
 
 
1160 aa  192  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.23 
 
 
1126 aa  186  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  27.63 
 
 
1093 aa  185  4e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  28.59 
 
 
1359 aa  179  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.02 
 
 
1360 aa  178  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  28.53 
 
 
1213 aa  176  2e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  28.43 
 
 
1359 aa  176  3e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 
1359 aa  176  3e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  28.43 
 
 
1350 aa  176  3e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  28.53 
 
 
1359 aa  175  4e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  28.53 
 
 
1359 aa  175  4e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  28.94 
 
 
1142 aa  174  8e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  26.28 
 
 
1050 aa  173  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.28 
 
 
1050 aa  173  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  27.99 
 
 
1094 aa  172  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 
956 aa  169  3e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.33 
 
 
1403 aa  156  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  25.98 
 
 
1067 aa  155  6e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  29.7 
 
 
1063 aa  155  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.54 
 
 
1053 aa  154  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.17 
 
 
1055 aa  151  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  26.23 
 
 
1289 aa  146  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
1298 aa  146  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  29.17 
 
 
1198 aa  146  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  28.6 
 
 
914 aa  143  2e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  26.95 
 
 
1123 aa  137  2e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.08 
 
 
1014 aa  136  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.22 
 
 
1080 aa  134  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.36 
 
 
1081 aa  134  1e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.15 
 
 
1096 aa  131  8e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.52 
 
 
1422 aa  124  1e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.68 
 
 
1226 aa  121  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  26.01 
 
 
1271 aa  120  2e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.9 
 
 
1295 aa  116  4e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  27.28 
 
 
900 aa  113  2e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.07 
 
 
1429 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  25.28 
 
 
1264 aa  109  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  3.02868e-06 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  28.88 
 
 
959 aa  107  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  28.5 
 
 
1006 aa  105  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  23.43 
 
 
1169 aa  105  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25 
 
 
1441 aa  103  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
973 aa  102  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  28.06 
 
 
1204 aa  102  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  30.45 
 
 
1123 aa  102  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  27.71 
 
 
961 aa  102  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.71 
 
 
954 aa  99.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.35 
 
 
1022 aa  98.6  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  23.17 
 
 
1020 aa  97.4  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  28.96 
 
 
983 aa  97.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  25.99 
 
 
967 aa  97.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  27.9 
 
 
966 aa  96.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.25 
 
 
1285 aa  95.5  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  28.69 
 
 
1123 aa  93.2  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  28.5 
 
 
1121 aa  92.8  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.8 
 
 
1190 aa  92.4  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  27.7 
 
 
919 aa  92  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  29.75 
 
 
967 aa  92  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  27.75 
 
 
1114 aa  91.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 
1340 aa  90.1  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.86 
 
 
1468 aa  90.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  28.61 
 
 
973 aa  88.2  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.21 
 
 
805 aa  87.8  1e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>