More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0914 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  100 
 
 		 250 aa  511  1e-144  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  56.41 
 
 		 253 aa  265  5e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  50.8 
 
 		 256 aa  248  9e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  50.2 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  47.6 
 
 		 277 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  47.41 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  47.2 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  50.2 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  50.2 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  45.34 
 
 		 255 aa  210  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  48.4 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  48.18 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  50.91 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  48.4 
 
 		 257 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  48.4 
 
 		 257 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  48.4 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  48 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  47.6 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  48 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  48 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  47.39 
 
 		 259 aa  201  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  43.75 
 
 		 268 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  42.8 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  42.8 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  48.06 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  44.84 
 
 		 308 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  43.37 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  51.6 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  53.48 
 
 		 216 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  43.48 
 
 		 338 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  46.57 
 
 		 232 aa  188  8e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  47.21 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  48.24 
 
 		 217 aa  187  2e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  52.69 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  44.76 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  53.89 
 
 		 207 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  47.94 
 
 		 204 aa  182  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  47.57 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  46.97 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  44.89 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  52.75 
 
 		 201 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  52.75 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  48.7 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  45.13 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  42.8 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  52.22 
 
 		 207 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  42 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  49.2 
 
 		 199 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  47.74 
 
 		 210 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  48.66 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  51.85 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  42 
 
 		 283 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 240 aa  175  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  50.5 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  51.11 
 
 		 207 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  51.11 
 
 		 207 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  50.79 
 
 		 207 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  53.89 
 
 		 203 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  47.67 
 
 		 205 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 218 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 213 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  49.22 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  50 
 
 		 217 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  50 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  48.13 
 
 		 209 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  46.63 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 211 aa  169  6e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  50 
 
 		 279 aa  168  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  48.4 
 
 		 198 aa  168  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  47.67 
 
 		 206 aa  168  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  41.46 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  49.21 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  49.21 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  49.44 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  48.39 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  48.39 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  45.92 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2878  RNase HII  49.72 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  48.09 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  48.92 
 
 		 209 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  48.92 
 
 		 209 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  47.62 
 
 		 198 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  47.62 
 
 		 198 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  51.34 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 202 aa  165  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 202 aa  165  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  47.62 
 
 		 198 aa  165  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 206 aa  164  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 198 aa  164  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  47.96 
 
 		 208 aa  164  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>