132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0379 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  100 
 
 		 844 aa  1709    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  32.56 
 
 		 851 aa  451  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  30.77 
 
 		 861 aa  438  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  30.15 
 
 		 847 aa  416  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  30.47 
 
 		 851 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  30.7 
 
 		 851 aa  376  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  26.45 
 
 		 859 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  26.45 
 
 		 859 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  26.96 
 
 		 861 aa  303  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  26.24 
 
 		 861 aa  301  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  26.04 
 
 		 861 aa  301  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  26.24 
 
 		 861 aa  301  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  26.04 
 
 		 861 aa  301  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  26.04 
 
 		 861 aa  301  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  26.04 
 
 		 861 aa  300  6e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  25.93 
 
 		 861 aa  300  6e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  26.92 
 
 		 858 aa  293  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  36.41 
 
 		 590 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  25.71 
 
 		 840 aa  264  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  25.71 
 
 		 840 aa  264  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  26.35 
 
 		 840 aa  256  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  31.21 
 
 		 569 aa  253  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  39.74 
 
 		 395 aa  232  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  27.79 
 
 		 854 aa  229  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  26.59 
 
 		 863 aa  222  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  26.27 
 
 		 863 aa  218  4e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  26.06 
 
 		 870 aa  216  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  26.27 
 
 		 813 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  27.84 
 
 		 867 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  29.72 
 
 		 854 aa  214  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  27.6 
 
 		 872 aa  213  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  27.75 
 
 		 871 aa  210  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  27.59 
 
 		 871 aa  209  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  24.85 
 
 		 869 aa  206  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  27.36 
 
 		 877 aa  201  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  26.47 
 
 		 880 aa  196  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  34.94 
 
 		 867 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  26.89 
 
 		 850 aa  196  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  26.31 
 
 		 880 aa  194  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  25.78 
 
 		 881 aa  193  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  32.31 
 
 		 866 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  25.59 
 
 		 877 aa  190  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  25.59 
 
 		 877 aa  190  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  33.23 
 
 		 556 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  33.23 
 
 		 556 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  25.25 
 
 		 883 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  33.44 
 
 		 896 aa  182  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  27.47 
 
 		 879 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  33.23 
 
 		 346 aa  181  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  32.26 
 
 		 568 aa  180  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  26.26 
 
 		 872 aa  179  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  32.11 
 
 		 556 aa  179  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  29.75 
 
 		 429 aa  178  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  29.81 
 
 		 855 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  31.76 
 
 		 557 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  30.53 
 
 		 864 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  30.91 
 
 		 850 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  33.55 
 
 		 875 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  30.58 
 
 		 850 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  30.53 
 
 		 844 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  30.58 
 
 		 850 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  30.58 
 
 		 850 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  30.11 
 
 		 850 aa  172  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  30.22 
 
 		 844 aa  171  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  30.58 
 
 		 850 aa  170  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  30.89 
 
 		 850 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  25.41 
 
 		 864 aa  169  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  27.65 
 
 		 880 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  27.65 
 
 		 880 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  27.48 
 
 		 880 aa  164  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  27.57 
 
 		 880 aa  164  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  25.27 
 
 		 880 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  25.11 
 
 		 880 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  24.79 
 
 		 850 aa  157  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  32.89 
 
 		 881 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  32.89 
 
 		 881 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  28.71 
 
 		 864 aa  146  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  30.16 
 
 		 862 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  23.35 
 
 		 864 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  32.28 
 
 		 876 aa  134  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  25.84 
 
 		 861 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  23.22 
 
 		 864 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  22.88 
 
 		 889 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  22.88 
 
 		 889 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  22.88 
 
 		 889 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  22.79 
 
 		 864 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  22.79 
 
 		 864 aa  127  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  29.07 
 
 		 875 aa  125  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  21.74 
 
 		 592 aa  108  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  24.38 
 
 		 839 aa  108  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  23.46 
 
 		 852 aa  106  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  23.66 
 
 		 723 aa  100  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  22.15 
 
 		 850 aa  99  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  23.61 
 
 		 905 aa  98.2  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  22.52 
 
 		 739 aa  96.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  22.22 
 
 		 1113 aa  96.3  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  22.9 
 
 		 1098 aa  95.5  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  23.3 
 
 		 917 aa  94.4  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  22.87 
 
 		 346 aa  92.8  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  21.74 
 
 		 857 aa  91.3  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>