201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1543 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1543  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0876912  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 204 aa  240  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3335  TrkA-C domain protein  45.23 
 
 		 213 aa  191  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.611638  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0117  TrkA domain-containing protein  45 
 
 		 214 aa  187  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1134  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000105089  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2589  GntR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  37.89 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1361  TrkA domain-containing protein  29.06 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00515151  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1615  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 208 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0410032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2149  regulatory protein GntR, HTH  34.55 
 
 		 215 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2291  GntR family transcription regulator  57.14 
 
 		 69 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000698422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  38.36 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  38.36 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  38.36 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  38.36 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  40.58 
 
 		 240 aa  52  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  40.58 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  41.56 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  27.05 
 
 		 125 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2287  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 250 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1934  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 250 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.127514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  28.57 
 
 		 163 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  37.14 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  32.14 
 
 		 164 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5004  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 242 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  38.57 
 
 		 268 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  30.11 
 
 		 245 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 245 aa  47.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7380  putative transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 308 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  34.78 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  32.18 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  37.68 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  32.35 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 256 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02920  predicted transcriptional regulator  36 
 
 		 119 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 254 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  33.33 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  33.33 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  41.3 
 
 		 160 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  38.24 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  33.33 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  28.28 
 
 		 161 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  33.33 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 233 aa  45.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1020  histidine utilization repressor  32.18 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  37.5 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0505  histidine utilization repressor  29.07 
 
 		 301 aa  45.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  30.59 
 
 		 238 aa  45.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  37.18 
 
 		 245 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  33.33 
 
 		 236 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  33.33 
 
 		 236 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  35.09 
 
 		 335 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  30.36 
 
 		 164 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 263 aa  45.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 241 aa  45.1  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  33.33 
 
 		 236 aa  45.1  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  33.33 
 
 		 236 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  33.33 
 
 		 236 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  37.5 
 
 		 252 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4217  regulatory protein GntR, HTH  31.88 
 
 		 346 aa  45.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.53296  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 256 aa  45.1  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 249 aa  44.7  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 234 aa  44.7  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  36 
 
 		 126 aa  44.7  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  36.62 
 
 		 236 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  38.81 
 
 		 251 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04510  regulatory protein GntR HTH  28.83 
 
 		 127 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  44.19 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  44.19 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  27.27 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  32.91 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  44.19 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  39.39 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 480 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  36.76 
 
 		 130 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>