129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1134 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1134  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  436  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000105089  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 204 aa  187  9e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1543  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0876912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3335  TrkA-C domain protein  38.19 
 
 		 213 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.611638  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0117  TrkA domain-containing protein  37.24 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2589  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1361  TrkA domain-containing protein  35.5 
 
 		 208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00515151  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1615  TrkA domain-containing protein  35 
 
 		 208 aa  134  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0410032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  33.5 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2149  regulatory protein GntR, HTH  26.6 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2291  GntR family transcription regulator  44.44 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000698422  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  36.84 
 
 		 335 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  36.84 
 
 		 335 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  36.84 
 
 		 335 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2648  histidine utilization repressor transcription regulator protein  37.88 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1934  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 250 aa  48.5  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.127514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2287  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 250 aa  48.5  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  33.78 
 
 		 258 aa  48.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  28.99 
 
 		 541 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  25.69 
 
 		 720 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  34.55 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  38.18 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3824  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0632  regulatory protein GntR HTH  34.33 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  34.48 
 
 		 764 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  32.86 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  34.29 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 232 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  32.43 
 
 		 258 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  35.38 
 
 		 255 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  35.29 
 
 		 258 aa  45.8  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  30 
 
 		 544 aa  45.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 257 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 246 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7380  putative transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 251 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 245 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2882  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  33.78 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 242 aa  45.1  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  32.31 
 
 		 232 aa  45.1  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 232 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  33.33 
 
 		 162 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0856057  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  33.33 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  33.33 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  27.85 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  36.73 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  47.62 
 
 		 673 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4323  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  33.82 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.469986 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  33.82 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2476  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  33.78 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00699876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0413  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 120 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126119  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4217  regulatory protein GntR, HTH  31.08 
 
 		 346 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.53296  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  31.25 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  31.25 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  38.89 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0274  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 141 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  35.71 
 
 		 401 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 141 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5710  sodium/hydrogen exchanger  31.11 
 
 		 679 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0497  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 265 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0337  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 105 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0510  trehalose operon repressor  32.35 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  29.41 
 
 		 568 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  24.1 
 
 		 771 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  31.08 
 
 		 160 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  35.94 
 
 		 544 aa  42.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3979  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  26.76 
 
 		 366 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562885  normal  0.577756 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  30.16 
 
 		 247 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  34.92 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2976  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845294  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3460  GntR domain-containing protein  30.77 
 
 		 248 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 471 aa  42.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04510  regulatory protein GntR HTH  36.9 
 
 		 127 aa  42.4  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4088  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199409  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3704  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.636639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 127 aa  42.4  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 122 aa  42.4  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4397  putative regulatory protein  25.33 
 
 		 240 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4399  GntR family regulatory protein  25.33 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>