149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0362 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 159 aa  319  8e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  54.43 
 
 		 162 aa  174  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  51.23 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  36.65 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  35.85 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  36.24 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  33.96 
 
 		 162 aa  97.4  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  34.18 
 
 		 164 aa  97.1  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  32.48 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  32.08 
 
 		 163 aa  90.9  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  33.12 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  30.72 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  30.72 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  30.72 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  30.72 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  30.72 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  30.72 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  30.72 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  30.07 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  30.07 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  32.3 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  30.07 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  35.62 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  35.62 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  35.62 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  32.69 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  30.61 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  30.61 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  29.52 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  29.93 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  29.93 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  29.73 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  31.68 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  29.05 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  29.05 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  29.05 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  29.05 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  29.05 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  30.19 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  32.91 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  30.67 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  31.9 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  28.3 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  30 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  29.81 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  41.1 
 
 		 762 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  29.81 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  32.12 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  33.55 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  45.83 
 
 		 771 aa  60.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  47.22 
 
 		 773 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  29.88 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  30.67 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  36.84 
 
 		 674 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  40.28 
 
 		 667 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  28.4 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  27.04 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  39.73 
 
 		 775 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  41.67 
 
 		 671 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  37.33 
 
 		 354 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  40.58 
 
 		 662 aa  52  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  26.42 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  34.65 
 
 		 664 aa  51.2  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0790  TrkA-C  39.34 
 
 		 410 aa  50.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000750791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  26.67 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  30.67 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  25.62 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 		 665 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  43.33 
 
 		 673 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 		 665 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  42.11 
 
 		 720 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  31.76 
 
 		 227 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  41.67 
 
 		 764 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  36.51 
 
 		 672 aa  48.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  36.51 
 
 		 215 aa  48.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  32.84 
 
 		 233 aa  47.8  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  37.84 
 
 		 331 aa  47.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  37.68 
 
 		 220 aa  47.4  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  25.78 
 
 		 225 aa  47.4  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.92 
 
 		 697 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1945  Citrate transporter  40.62 
 
 		 778 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.162435  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  43.33 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1543  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0876912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  40.3 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  40.38 
 
 		 609 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  28.79 
 
 		 335 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  41.27 
 
 		 356 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  41.27 
 
 		 356 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  34.67 
 
 		 338 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  39.68 
 
 		 362 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  42.86 
 
 		 581 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  41.38 
 
 		 611 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  32.88 
 
 		 336 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 674 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  35 
 
 		 347 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  41.82 
 
 		 233 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  36.07 
 
 		 332 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  33.87 
 
 		 400 aa  44.3  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  29.58 
 
 		 217 aa  44.3  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>