208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2191 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  100 
 
 
162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  54.43 
 
 
159 aa  174  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  49.07 
 
 
162 aa  160  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  35.58 
 
 
163 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  35.22 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  34.16 
 
 
162 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  36.31 
 
 
164 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  32.9 
 
 
165 aa  104  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  37.74 
 
 
164 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  34.39 
 
 
164 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  36.13 
 
 
165 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  36.13 
 
 
164 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  36.13 
 
 
164 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  36.13 
 
 
165 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  35.48 
 
 
165 aa  97.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  36.13 
 
 
169 aa  97.4  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  36.13 
 
 
169 aa  97.4  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  34.84 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  34.84 
 
 
165 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  34.84 
 
 
165 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  35.71 
 
 
165 aa  94  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  35.06 
 
 
165 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  35.06 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  34.87 
 
 
165 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  35.06 
 
 
165 aa  90.9  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  35.06 
 
 
165 aa  90.9  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  35.06 
 
 
165 aa  90.9  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  35.06 
 
 
165 aa  90.9  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  35.06 
 
 
165 aa  90.9  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  34.42 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  35.26 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  29.19 
 
 
163 aa  88.2  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  29.7 
 
 
166 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  31.45 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  35 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  32.1 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  31.85 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  36.42 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  36.42 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  36.42 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  41.57 
 
 
674 aa  67  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  32.47 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  29.33 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  29.14 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  34.19 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  43.66 
 
 
667 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  28.4 
 
 
160 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  27.17 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  27.33 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  31.68 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  29.27 
 
 
160 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  40.58 
 
 
662 aa  57.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  41.82 
 
 
764 aa  57.4  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  41.43 
 
 
762 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  30.54 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  27.67 
 
 
196 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  27.5 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 
775 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  43.06 
 
 
666 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  27.67 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  39.66 
 
 
220 aa  54.3  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  39.66 
 
 
220 aa  54.3  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  39.19 
 
 
773 aa  53.9  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  39.66 
 
 
219 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  28.37 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  45.9 
 
 
673 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
335 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  41.54 
 
 
771 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  30.68 
 
 
330 aa  52.4  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5523  potassium channel, putative  32.18 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  41.94 
 
 
224 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  31.62 
 
 
567 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  25.71 
 
 
351 aa  51.2  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  30.71 
 
 
542 aa  51.2  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  35.06 
 
 
337 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  31.07 
 
 
354 aa  50.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  27.73 
 
 
567 aa  50.8  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 
335 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  23.57 
 
 
160 aa  50.8  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  34.25 
 
 
650 aa  50.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  39.71 
 
 
671 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  30.33 
 
 
541 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  30.68 
 
 
334 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  29.87 
 
 
225 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  44.23 
 
 
720 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 
335 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  35.14 
 
 
664 aa  50.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  40 
 
 
220 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  25.17 
 
 
213 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  36.36 
 
 
665 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  32.67 
 
 
608 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  29.55 
 
 
334 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  38.96 
 
 
672 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  30.3 
 
 
605 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  26.89 
 
 
568 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  38.1 
 
 
221 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  38.1 
 
 
221 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  38.1 
 
 
221 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  38.1 
 
 
221 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  38.1 
 
 
221 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>