132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0917 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 166 aa  326  7e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  56.88 
 
 		 160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  52.5 
 
 		 160 aa  167  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  50 
 
 		 186 aa  159  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  50 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  47.47 
 
 		 195 aa  153  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  55.62 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  48.12 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  51.25 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  50.62 
 
 		 196 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  45.62 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  45.62 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  45.62 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  41.88 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  47.5 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  43.12 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  43.75 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  45.62 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  46.5 
 
 		 161 aa  133  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  45.03 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  43.31 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  42.77 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  29.56 
 
 		 164 aa  90.5  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  30.82 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  30.19 
 
 		 164 aa  87.4  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  28.57 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  27.27 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  27.27 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  27.27 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  27.27 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  27.27 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  27.27 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  34 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  28.22 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  32.91 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  29.88 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  38.46 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  32.47 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  24.36 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  24.69 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  24.69 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  28.75 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  24.07 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  24.07 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  24.07 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  24.07 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  24.07 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  24.07 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  45.16 
 
 		 674 aa  62  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  32.52 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  26.71 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  23.46 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  22.84 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  41.67 
 
 		 662 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  38.89 
 
 		 671 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  35.64 
 
 		 673 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  36.49 
 
 		 693 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  34.44 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  35.82 
 
 		 666 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  35.82 
 
 		 672 aa  51.6  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  50 
 
 		 764 aa  51.2  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  36.9 
 
 		 710 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  36.17 
 
 		 667 aa  50.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  35.82 
 
 		 666 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5710  sodium/hydrogen exchanger  35.62 
 
 		 679 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  41.51 
 
 		 771 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.84 
 
 		 697 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  34.52 
 
 		 652 aa  48.5  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  34.74 
 
 		 222 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  37.18 
 
 		 544 aa  48.1  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  34.74 
 
 		 222 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0601  hypothetical protein  33.72 
 
 		 90 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0579  hypothetical protein  33.72 
 
 		 90 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6030  hypothetical protein  32.58 
 
 		 90 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176794  normal  0.984792 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  37.68 
 
 		 350 aa  47.4  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  34.21 
 
 		 668 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  36.92 
 
 		 354 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  28.42 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  39.06 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  31.73 
 
 		 405 aa  45.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  36.84 
 
 		 568 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  29.09 
 
 		 401 aa  45.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  37.29 
 
 		 542 aa  45.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  26.04 
 
 		 335 aa  44.7  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  35.71 
 
 		 650 aa  44.3  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  35.21 
 
 		 664 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  26.04 
 
 		 335 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  26.04 
 
 		 335 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  30.3 
 
 		 630 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  37.25 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  26.44 
 
 		 676 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  30.65 
 
 		 589 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  32.2 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  28.17 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>