99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2893 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
177 aa  344  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
177 aa  344  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  100 
 
 
177 aa  344  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  78.12 
 
 
160 aa  247  8e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  70.39 
 
 
154 aa  203  9e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  57.59 
 
 
161 aa  175  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  57.79 
 
 
161 aa  170  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  50.62 
 
 
186 aa  158  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  50.62 
 
 
160 aa  158  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  51.25 
 
 
160 aa  155  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  51.25 
 
 
160 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  50.62 
 
 
160 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  48.12 
 
 
160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  45.62 
 
 
166 aa  143  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  47.33 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  46.25 
 
 
160 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  49.37 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  48.92 
 
 
160 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  43.75 
 
 
160 aa  128  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  48.73 
 
 
196 aa  127  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  43.04 
 
 
159 aa  120  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  38.75 
 
 
160 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  29.8 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  27.44 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  28.92 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  35.62 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  30.25 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  25.79 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  36.24 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  36.42 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  32.68 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  29.14 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  29.14 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  29.14 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  29.14 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  28.22 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  29.14 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  29.14 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  27.89 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  27.89 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  26.58 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 
165 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  26.58 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  26.58 
 
 
164 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  26.58 
 
 
164 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  26.99 
 
 
165 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  26.58 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 
169 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 
169 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  26.58 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  28.4 
 
 
162 aa  58.2  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  43.48 
 
 
673 aa  57.8  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  33.72 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  34.81 
 
 
405 aa  56.6  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  28.12 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  24.68 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  49.21 
 
 
671 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 
674 aa  54.7  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  30.52 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  31.58 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  50.98 
 
 
662 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  35.42 
 
 
233 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  47.17 
 
 
217 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
204 aa  47.8  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  28.99 
 
 
335 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  44.07 
 
 
710 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  29.73 
 
 
227 aa  46.2  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  28.99 
 
 
335 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
667 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  47.17 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  32.47 
 
 
636 aa  45.1  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1543  GntR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
206 aa  44.7  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0876912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  26.6 
 
 
684 aa  44.7  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  40 
 
 
541 aa  44.7  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  33.33 
 
 
720 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  27.74 
 
 
401 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  33.8 
 
 
672 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  27.54 
 
 
335 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.7 
 
 
697 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  26.92 
 
 
674 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
214 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  31.75 
 
 
217 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0601  hypothetical protein  32.94 
 
 
90 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  35.8 
 
 
672 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0579  hypothetical protein  32.94 
 
 
90 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  35.38 
 
 
354 aa  42.4  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 
371 aa  41.6  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  35.53 
 
 
544 aa  41.6  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  37.31 
 
 
568 aa  41.6  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  28.95 
 
 
544 aa  41.2  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  40 
 
 
399 aa  41.2  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  56.76 
 
 
220 aa  40.8  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  31.51 
 
 
350 aa  40.8  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  32.79 
 
 
215 aa  41.2  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  30.43 
 
 
222 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0838  TrkA-C domain protein  28.89 
 
 
405 aa  40.8  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>