116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1157 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  100 
 
 		 195 aa  394  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  47.47 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  44.65 
 
 		 186 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  47.47 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  46.25 
 
 		 160 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  46.25 
 
 		 160 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  41.77 
 
 		 160 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  46.88 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  43.95 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  47.02 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  47.13 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  50 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  47.33 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  47.33 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  47.33 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  41.4 
 
 		 160 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  42.5 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  47.37 
 
 		 154 aa  127  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  41.14 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  41.51 
 
 		 161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  43.67 
 
 		 160 aa  121  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  40.67 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  34.62 
 
 		 163 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  34.59 
 
 		 164 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  33.74 
 
 		 164 aa  91.7  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  32.47 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  32.47 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  32.47 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  32.47 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  31.82 
 
 		 165 aa  89  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  31.82 
 
 		 165 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  32.47 
 
 		 165 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 		 165 aa  88.2  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  32.47 
 
 		 169 aa  87.8  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  32.47 
 
 		 169 aa  87.8  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  32.08 
 
 		 165 aa  86.7  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  31.76 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  32.3 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  30.61 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  30.61 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  30.61 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  30.61 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  35.95 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  30.61 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  30.61 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  29.25 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  29.25 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  29.93 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  31.45 
 
 		 162 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  30.43 
 
 		 163 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  29.93 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  29.27 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  30.63 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  28.97 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  29.25 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  26.4 
 
 		 764 aa  61.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  39.06 
 
 		 652 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  40.28 
 
 		 673 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  39.51 
 
 		 662 aa  55.1  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  26.14 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  42.25 
 
 		 671 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0601  hypothetical protein  34.12 
 
 		 90 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0579  hypothetical protein  34.12 
 
 		 90 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  31.18 
 
 		 771 aa  49.3  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  41.54 
 
 		 720 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  35.71 
 
 		 693 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  36.23 
 
 		 771 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  28.74 
 
 		 674 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 		 684 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  30.77 
 
 		 90 aa  47.8  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.05 
 
 		 697 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  32.97 
 
 		 773 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  43.1 
 
 		 656 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  36.36 
 
 		 356 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  32.05 
 
 		 672 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  36.36 
 
 		 356 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  30.67 
 
 		 676 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  44.23 
 
 		 544 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  30.36 
 
 		 350 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  37.93 
 
 		 664 aa  45.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 666 aa  45.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 		 762 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 667 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  25.64 
 
 		 666 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  34.12 
 
 		 581 aa  45.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 		 658 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  32.61 
 
 		 668 aa  44.7  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2589  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  36.36 
 
 		 355 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1361  TrkA domain-containing protein  35.94 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00515151  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1543  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0876912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  29.58 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  35.38 
 
 		 401 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  30.99 
 
 		 354 aa  42.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  30.99 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  31.43 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  27.56 
 
 		 332 aa  43.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  35.48 
 
 		 362 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>