39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0579 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0579  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0601  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6030  hypothetical protein  54.55 
 
 
90 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176794  normal  0.984792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  46.84 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  38.37 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  35.96 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  35.96 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  36.05 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  33.72 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
186 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  38.37 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  32.97 
 
 
160 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  34.12 
 
 
195 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  39.39 
 
 
196 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  38.24 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  33.72 
 
 
166 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  37.65 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  38.46 
 
 
154 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  30.77 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  34.12 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  30.77 
 
 
165 aa  42  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  32.94 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  32.94 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  32.94 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 
165 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  30.77 
 
 
165 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  30.77 
 
 
165 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  30.77 
 
 
165 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  30.77 
 
 
165 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  30.77 
 
 
164 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  30.77 
 
 
164 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  30.77 
 
 
165 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 
165 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 
165 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 
165 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  29.23 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  29.23 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>