248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1338 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  44.27 
 
 		 212 aa  158  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2589  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2149  regulatory protein GntR, HTH  38.04 
 
 		 215 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1615  TrkA domain-containing protein  34.57 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0410032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1361  TrkA domain-containing protein  34.57 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00515151  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0117  TrkA domain-containing protein  33.17 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3335  TrkA-C domain protein  32.83 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.611638  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 204 aa  107  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1543  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0876912  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1134  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 213 aa  94.7  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000105089  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2291  GntR family transcription regulator  50.88 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000698422  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  43.84 
 
 		 720 aa  58.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  36.11 
 
 		 544 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  33.7 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  36.23 
 
 		 160 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  31.85 
 
 		 668 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1044  hypothetical protein  32.79 
 
 		 399 aa  52.4  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  35.23 
 
 		 161 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  33.71 
 
 		 154 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  23.68 
 
 		 652 aa  51.2  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  37.1 
 
 		 159 aa  51.2  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  39.34 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  31.18 
 
 		 160 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  36.49 
 
 		 405 aa  50.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03974  predicted DNA-binding transcriptional regulator of phosphonate uptake and biodegradation  34.34 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3889  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  34.34 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  37.88 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5615  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  34.34 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7380  putative transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 		 662 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  31.88 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6234  regulatory protein GntR HTH  34.78 
 
 		 514 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  30.68 
 
 		 676 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4656  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  34.34 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3924  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  34.34 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4568  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  34.34 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03934  hypothetical protein  34.34 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  35.29 
 
 		 165 aa  49.3  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  41.79 
 
 		 664 aa  48.9  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  32.98 
 
 		 243 aa  48.5  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  34.74 
 
 		 350 aa  48.5  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 249 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  36.07 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  32.03 
 
 		 161 aa  48.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  32.53 
 
 		 240 aa  48.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 284 aa  48.1  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 262 aa  48.1  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  32.53 
 
 		 240 aa  48.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  33.75 
 
 		 169 aa  48.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  33.75 
 
 		 169 aa  48.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3559  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  29.63 
 
 		 241 aa  48.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  33.75 
 
 		 165 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  33.82 
 
 		 710 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  32.5 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3693  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  29.63 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189097  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  31.87 
 
 		 400 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  34.57 
 
 		 693 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  40.3 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  32.39 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  37.5 
 
 		 671 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  32.58 
 
 		 346 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 376 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4032  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  31.31 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  32.5 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  32.86 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  32.5 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  35.48 
 
 		 613 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  32.86 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6099  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  40 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0306  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  34.34 
 
 		 241 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.275672  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4955  putative transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 248 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  31.25 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  31.25 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 259 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  36.62 
 
 		 399 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  31.25 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4343  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  33.33 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  39.06 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  32.47 
 
 		 258 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 251 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  30 
 
 		 160 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  31.25 
 
 		 165 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 266 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 266 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 266 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 266 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 266 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  29.79 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4699  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 270 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  33.33 
 
 		 160 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  35.21 
 
 		 255 aa  45.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 332 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  29.03 
 
 		 335 aa  45.4  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>