65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0407 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  100 
 
 
158 aa  309  7.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  35.48 
 
 
165 aa  123  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  35.48 
 
 
169 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  35.48 
 
 
169 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  39.24 
 
 
166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  32.68 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  35.48 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  35.48 
 
 
164 aa  111  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  35.48 
 
 
164 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  34.84 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  35.48 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  36.6 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  33.55 
 
 
165 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  37.93 
 
 
164 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  33.55 
 
 
165 aa  107  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  34.44 
 
 
164 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  33.55 
 
 
165 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  32.9 
 
 
165 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  32.9 
 
 
165 aa  104  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  35 
 
 
162 aa  104  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  32.26 
 
 
165 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  32.26 
 
 
165 aa  103  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  32.26 
 
 
165 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  32.26 
 
 
165 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  32.26 
 
 
165 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  32.26 
 
 
165 aa  103  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  31.61 
 
 
165 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  31.61 
 
 
165 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  34.19 
 
 
163 aa  97.8  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  35.26 
 
 
162 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  31.71 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  35.95 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  32.69 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  34 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  36.24 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  36.24 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  36.24 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  34 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  32.67 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  34.64 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  32.89 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  34.01 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  34.01 
 
 
196 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  31.29 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  32.43 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  28.03 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  31.21 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  29.87 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  31.29 
 
 
160 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  29.88 
 
 
164 aa  61.2  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  29.93 
 
 
160 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  31.68 
 
 
159 aa  57.8  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  31.54 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  28.66 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  26.75 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2149  regulatory protein GntR, HTH  35.9 
 
 
215 aa  44.7  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  36.05 
 
 
627 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
214 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3603  TrkA domain-containing protein  48 
 
 
229 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  43.55 
 
 
222 aa  41.6  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  28.77 
 
 
206 aa  41.2  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  37.33 
 
 
220 aa  40.8  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  37.5 
 
 
371 aa  40.8  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  32.94 
 
 
666 aa  40.4  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>