90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0120 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
196 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  95.78 
 
 
166 aa  278  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  56.33 
 
 
160 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  58.13 
 
 
160 aa  180  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  56.96 
 
 
160 aa  175  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  55.62 
 
 
160 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  55 
 
 
186 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  50.62 
 
 
166 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  47.02 
 
 
195 aa  154  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  53.12 
 
 
160 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  53.28 
 
 
160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  46.25 
 
 
160 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  48.73 
 
 
177 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  48.73 
 
 
177 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  48.73 
 
 
177 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  47.5 
 
 
160 aa  137  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  45 
 
 
160 aa  137  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  46.2 
 
 
160 aa  135  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  46.15 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  48 
 
 
154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  43.23 
 
 
161 aa  124  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  43.31 
 
 
161 aa  118  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  29.56 
 
 
164 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  28.93 
 
 
163 aa  85.9  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  28.3 
 
 
164 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  24.68 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  31.21 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  27.74 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  33.99 
 
 
158 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  27.1 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  27.1 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  27.1 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  27.1 
 
 
165 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  26.45 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  26.45 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  26.45 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  26.45 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  26.45 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  26.45 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  28.12 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  28.67 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  28.67 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  28.67 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  28.67 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  28.67 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  28 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  26.67 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  26.67 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  28 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  26.67 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  28.93 
 
 
162 aa  63.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  32.45 
 
 
162 aa  63.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  27.21 
 
 
163 aa  56.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  26.57 
 
 
164 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  27.67 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  53.33 
 
 
662 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  36.36 
 
 
771 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  30.16 
 
 
401 aa  51.2  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0579  hypothetical protein  31.87 
 
 
90 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6030  hypothetical protein  33.72 
 
 
90 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176794  normal  0.984792 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0601  hypothetical protein  31.87 
 
 
90 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  35.44 
 
 
90 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2589  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1361  TrkA domain-containing protein  31.43 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00515151  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  41.89 
 
 
544 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1615  TrkA domain-containing protein  31.43 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0410032  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  48.89 
 
 
652 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  36 
 
 
720 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  34.88 
 
 
568 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  33.87 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  28.57 
 
 
405 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 
674 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  38.18 
 
 
222 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
204 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  32.79 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  32.73 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  33.9 
 
 
664 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 
636 aa  42.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  29.85 
 
 
684 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  36.36 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  34.48 
 
 
671 aa  42.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  33.8 
 
 
693 aa  42  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  31.08 
 
 
764 aa  42  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
673 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  35.09 
 
 
542 aa  41.2  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>