125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_5188 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
165 aa  333  5e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  99.39 
 
 
165 aa  332  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  98.18 
 
 
165 aa  328  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  98.79 
 
 
165 aa  328  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  99.39 
 
 
164 aa  327  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  99.39 
 
 
164 aa  327  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  97.58 
 
 
165 aa  327  7e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  97.58 
 
 
165 aa  326  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  98.16 
 
 
169 aa  322  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  98.16 
 
 
169 aa  322  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  78.53 
 
 
165 aa  278  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  78.53 
 
 
165 aa  278  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  78.53 
 
 
165 aa  278  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  78.53 
 
 
165 aa  277  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  77.91 
 
 
165 aa  276  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  77.91 
 
 
165 aa  276  8e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  77.91 
 
 
165 aa  276  8e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  77.91 
 
 
165 aa  276  8e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  77.91 
 
 
165 aa  276  8e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  77.91 
 
 
165 aa  276  8e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  63.8 
 
 
164 aa  225  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  58.54 
 
 
163 aa  189  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  56.25 
 
 
164 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  53.64 
 
 
164 aa  173  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  46.91 
 
 
162 aa  164  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  36.97 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  38.71 
 
 
165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  35.48 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  34.19 
 
 
163 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  32.68 
 
 
162 aa  101  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  36.13 
 
 
162 aa  99  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  32.47 
 
 
195 aa  89.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  30.72 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  30.86 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  30.38 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  27.27 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  26.61 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  27.95 
 
 
186 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  31.71 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  26.75 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  27.1 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  28.66 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  26.45 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  26.43 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  28 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  26.76 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  28.48 
 
 
154 aa  67  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  28 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  27.33 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  28 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  26.58 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  26.58 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  25.17 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  26.58 
 
 
160 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  39.39 
 
 
217 aa  53.9  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  40.28 
 
 
227 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  27.5 
 
 
331 aa  52.4  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  42.62 
 
 
673 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  32.91 
 
 
674 aa  51.2  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  36.84 
 
 
232 aa  50.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 
674 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
350 aa  50.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  29.79 
 
 
346 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  40.96 
 
 
221 aa  50.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  32.08 
 
 
668 aa  50.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  24.2 
 
 
350 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  37.5 
 
 
636 aa  48.9  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  38.57 
 
 
233 aa  49.3  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  30.61 
 
 
330 aa  48.1  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  36.11 
 
 
222 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 
201 aa  47.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  31.25 
 
 
233 aa  46.6  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  34.29 
 
 
652 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 
671 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  43.55 
 
 
664 aa  45.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  29.87 
 
 
219 aa  45.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  30.53 
 
 
223 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  32.84 
 
 
771 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  25.33 
 
 
762 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  35.71 
 
 
682 aa  44.7  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  36.36 
 
 
231 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  35.38 
 
 
224 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  26 
 
 
350 aa  44.3  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  26 
 
 
350 aa  44.3  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  23.08 
 
 
350 aa  44.3  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  30.59 
 
 
567 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  29.69 
 
 
775 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  31.43 
 
 
337 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  28.09 
 
 
371 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  28.05 
 
 
666 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  30.14 
 
 
222 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  20.99 
 
 
676 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  28.97 
 
 
399 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  30 
 
 
234 aa  42.4  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  33.85 
 
 
541 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  32.26 
 
 
225 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  30.49 
 
 
666 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>