269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_1689 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
214 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  40.1 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2149  regulatory protein GntR, HTH  40.11 
 
 
215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2589  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
206 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1615  TrkA domain-containing protein  31.79 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0410032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1361  TrkA domain-containing protein  31.79 
 
 
208 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00515151  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1134  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
213 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000105089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0117  TrkA domain-containing protein  31.31 
 
 
214 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3335  TrkA-C domain protein  27.78 
 
 
213 aa  98.6  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.611638  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1543  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0876912  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  34.95 
 
 
400 aa  64.3  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  35.44 
 
 
664 aa  55.5  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2291  GntR family transcription regulator  50.94 
 
 
69 aa  55.5  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000698422  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  41.43 
 
 
350 aa  55.1  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1044  hypothetical protein  37.11 
 
 
399 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  41.94 
 
 
160 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  32.88 
 
 
163 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0838  TrkA-C domain protein  28.05 
 
 
405 aa  52.8  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  27.48 
 
 
693 aa  52.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
252 aa  51.6  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  40 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  40 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  37.01 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  37.01 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  37.01 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  34.57 
 
 
399 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  40.91 
 
 
773 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  37.01 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  37.01 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  40 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  29.55 
 
 
350 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  40 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  29.55 
 
 
350 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  38.81 
 
 
619 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.72 
 
 
479 aa  49.3  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  37.68 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  39.06 
 
 
244 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  39.06 
 
 
244 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.77 
 
 
474 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.77 
 
 
478 aa  48.9  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  35.21 
 
 
332 aa  48.9  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  35.62 
 
 
161 aa  48.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  37.14 
 
 
605 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  37.88 
 
 
771 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.63 
 
 
476 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  35.21 
 
 
332 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  35.29 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0790  TrkA-C  41.07 
 
 
410 aa  47.4  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000750791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  34.41 
 
 
355 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  29.08 
 
 
160 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1994  TrkA-C domain protein  40.58 
 
 
422 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0532904 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0734  hypothetical protein  36.76 
 
 
402 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  32.26 
 
 
354 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  32.05 
 
 
258 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0266  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  43.94 
 
 
245 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  39.68 
 
 
166 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0932  TrkA-C domain protein  28 
 
 
190 aa  47  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  38.24 
 
 
159 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  37.66 
 
 
574 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  36.11 
 
 
666 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  37.84 
 
 
251 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6234  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 
514 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  34.02 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  41.03 
 
 
616 aa  46.6  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3363  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.638861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  33.01 
 
 
609 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
119 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4125  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  43.94 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  33.01 
 
 
609 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  34.92 
 
 
160 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  39.29 
 
 
160 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  33.33 
 
 
159 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
471 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  38.46 
 
 
627 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  32.38 
 
 
338 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  41.27 
 
 
253 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  33.8 
 
 
482 aa  45.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 
665 aa  45.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  27.54 
 
 
741 aa  45.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  32.43 
 
 
544 aa  45.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  43.1 
 
 
613 aa  45.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  38.46 
 
 
220 aa  45.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
269 aa  45.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
477 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4707  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
229 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  34.25 
 
 
609 aa  45.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
471 aa  45.4  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  34.62 
 
 
609 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  32.86 
 
 
351 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0887  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
253 aa  45.1  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4447  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
238 aa  45.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  36.36 
 
 
574 aa  45.1  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0787  GntR domain protein  43.94 
 
 
237 aa  45.1  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  30 
 
 
405 aa  44.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  39.13 
 
 
665 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  35.53 
 
 
581 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>