152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0407 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 161 aa  305  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  62.09 
 
 		 154 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  57.59 
 
 		 177 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  57.59 
 
 		 177 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  57.59 
 
 		 177 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  57.32 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  52.53 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  52.23 
 
 		 186 aa  161  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  51.59 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  52.23 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  53.5 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  49.04 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  54.2 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  50.36 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  46.5 
 
 		 166 aa  133  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  41.51 
 
 		 195 aa  125  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  43.4 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  43.87 
 
 		 166 aa  117  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  43.23 
 
 		 196 aa  113  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  38.85 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  38.85 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  37.58 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  28.48 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  28.85 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  26.92 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  24.68 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  26.88 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  26.99 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  26.58 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  26.58 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  26.58 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  26.58 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  26.58 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  26.58 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  32.12 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  27.17 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  24.54 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  30.49 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  23.93 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  25.17 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  25.17 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  25.17 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  25.17 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  25.17 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  25.17 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  25.17 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  24.49 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  27.04 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6030  hypothetical protein  36.05 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176794  normal  0.984792 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  28.21 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  28.66 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  49.25 
 
 		 662 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  32.38 
 
 		 674 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  43.66 
 
 		 544 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0601  hypothetical protein  38.37 
 
 		 90 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0579  hypothetical protein  38.37 
 
 		 90 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 201 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  44.07 
 
 		 673 aa  51.6  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  45.76 
 
 		 671 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  37.84 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  36.27 
 
 		 710 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  28 
 
 		 401 aa  49.7  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  28.21 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0107  Citrate transporter  36.84 
 
 		 545 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0878847  normal  0.704215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  24.55 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0932  TrkA-C domain protein  32.86 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  40.58 
 
 		 720 aa  48.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 214 aa  48.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  36.76 
 
 		 542 aa  48.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  44.64 
 
 		 664 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  30.88 
 
 		 221 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  30.88 
 
 		 221 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  30.88 
 
 		 221 aa  47.8  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  30.88 
 
 		 221 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  30.88 
 
 		 221 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  30.88 
 
 		 221 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  30.88 
 
 		 221 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  30.88 
 
 		 221 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  30.88 
 
 		 221 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  29.41 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  30.88 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1543  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0876912  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  26.73 
 
 		 336 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  32.05 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  39.34 
 
 		 220 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  40.62 
 
 		 672 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  33.82 
 
 		 608 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  40.68 
 
 		 356 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  30.3 
 
 		 665 aa  45.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0838  TrkA-C domain protein  29.03 
 
 		 405 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  33.82 
 
 		 605 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  40.68 
 
 		 356 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  32 
 
 		 405 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.57 
 
 		 663 aa  44.3  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  35.48 
 
 		 231 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  41.27 
 
 		 598 aa  44.3  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>