31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1522 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1522  TrkA-C domain protein  100 
 
 
405 aa  779    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.551094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0838  TrkA-C domain protein  79 
 
 
405 aa  570  1e-161  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  62.63 
 
 
401 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0368  TrkA-C domain protein  60.86 
 
 
404 aa  443  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2811  potassium channel protein  44.5 
 
 
399 aa  336  5e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.775034  normal  0.031805 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  43.07 
 
 
400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0790  TrkA-C  42.11 
 
 
410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000750791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1044  hypothetical protein  42.71 
 
 
399 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0734  hypothetical protein  42.22 
 
 
402 aa  281  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2179  PhoU family protein  68.82 
 
 
310 aa  209  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0292095  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0931  PhoU family protein  38.3 
 
 
184 aa  124  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0932  TrkA-C domain protein  36.99 
 
 
190 aa  123  6e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  34.81 
 
 
177 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  34.81 
 
 
177 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  34.81 
 
 
177 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 
201 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 
636 aa  49.7  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  35.48 
 
 
160 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  35.9 
 
 
674 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  41.67 
 
 
664 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  31.73 
 
 
166 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  31.33 
 
 
624 aa  45.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  28.81 
 
 
186 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  35.48 
 
 
160 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
214 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  36.62 
 
 
337 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  30.36 
 
 
164 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  31.2 
 
 
161 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  35.29 
 
 
764 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  35 
 
 
332 aa  43.1  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>