More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1200 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 212 aa  421  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2589  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0117  TrkA domain-containing protein  41.87 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1615  TrkA domain-containing protein  39.7 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0410032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  44.27 
 
 		 201 aa  158  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1361  TrkA domain-containing protein  39.7 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00515151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3335  TrkA-C domain protein  37.95 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.611638  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1543  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0876912  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 204 aa  137  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1134  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000105089  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2149  regulatory protein GntR, HTH  40.32 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2291  GntR family transcription regulator  46.88 
 
 		 69 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000698422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  39.68 
 
 		 664 aa  58.9  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  32.89 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  31.58 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  31.58 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  31.58 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  43.33 
 
 		 605 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  34.44 
 
 		 166 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  38.89 
 
 		 164 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  38.81 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  33.78 
 
 		 656 aa  52  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2228  regulatory protein GntR HTH  42.25 
 
 		 370 aa  52  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.916284  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  38.03 
 
 		 710 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  41.67 
 
 		 608 aa  52  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  40.32 
 
 		 567 aa  51.6  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  42.65 
 
 		 693 aa  51.6  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  41.79 
 
 		 668 aa  51.6  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  35.71 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  31.17 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0013  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000501062  n/a   
 
 
 
NC_011830  Dhaf_0274  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 141 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 285 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  34.94 
 
 		 662 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0534  transcriptional regulator  31.01 
 
 		 300 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.207932  hitchhiker  0.0000000000234574 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02920  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 119 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1409  transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0851  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 359 aa  50.8  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0546465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 127 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  41.54 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 280 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3824  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  29.49 
 
 		 627 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 666 aa  49.3  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  44.93 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5849  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  42.62 
 
 		 720 aa  49.7  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 254 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  40.62 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  42.25 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  28.21 
 
 		 161 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 259 aa  48.9  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  44.44 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  37.5 
 
 		 636 aa  48.5  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 117 aa  48.5  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 126 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  34.44 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.2 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 462 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  32.22 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4088  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199409  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0752  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00012009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  39.44 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  38.81 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  32.22 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  39.44 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  40.98 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  40.98 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4344  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 75 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366486  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  40.98 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  40.98 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  40.98 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  40.98 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 243 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  31.78 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  34.33 
 
 		 163 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  32.18 
 
 		 568 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  38.33 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  40.98 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  38.1 
 
 		 165 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  40.98 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  40.62 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  30.11 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  40.98 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  32.26 
 
 		 160 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>